Paket: samtools (1.22.1-1 ve diğerleri)

samtools için bağlantılar

Debian Kaynakları:

samtools Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Ana Sayfa [www.htslib.org]

Benzer paketler:

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Etiketler: Alan: Biyoloji, Biyoinformatik, Geliştirildiği dil: implemented-in::c, interface::commandline, Ağ: İstemci, Ağ Protokolü: FTP, protocol::http, role::program, Kapsam: Yardımcı Araç, Arayüz Araç Takımı: Ncurses TUI, Amaç: use::analysing, use::calculating, Filtreleme, Şununla çalışır: Biyolojik Dizi

samtools ile İlgili Diğer Paketler

bağımlılıklar

tavsiye edilen

önerilen

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, loong64, sh4 değil]

GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libhts3t64 (>= 1.17) [ia64]

C library for high-throughput sequencing data formats

dep: libhts3t64 (>= 1.22.1+ds-1) [ia64 değil]
dep: libncurses6 (>= 6)

shared libraries for terminal handling
dep: libtinfo6 (>= 6)

shared low-level terminfo library for terminal handling
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [alpha, armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4 değil]

compression library - runtime

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [alpha, armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

sug: cwltool

Common Workflow Language reference implementation

samtools indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	1.22.1-1	673,3 kB	1.886,0 kB	[dosya listesi]
amd64	1.22.1-1	680,3 kB	1.495,0 kB	[dosya listesi]
arm64	1.22.1-1	650,1 kB	1.755,0 kB	[dosya listesi]
armel	1.22.1-1	640,8 kB	1.748,0 kB	[dosya listesi]
armhf	1.22.1-1	645,0 kB	1.556,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	1.22.1-1	677,6 kB	1.439,0 kB	[dosya listesi]
i386	1.22.1-1	713,4 kB	1.632,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	1.19.2-1+b1	716,1 kB	2.112,0 kB	[dosya listesi]
loong64 (resmi olmayan port)	1.22.1-1	666,7 kB	1.814,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	1.22.1-1	648,3 kB	1.420,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	1.22.1-1	657,9 kB	1.907,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	1.22.1-1	693,8 kB	2.011,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	1.22.1-1	706,9 kB	2.011,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	1.22.1-1	685,7 kB	1.339,0 kB	[dosya listesi]
s390x	1.22.1-1	683,6 kB	1.555,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	1.22.1-1	742,2 kB	1.686,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	1.22.1-1	641,8 kB	7.784,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	1.22.1-1	683,9 kB	1.460,0 kB	[dosya listesi]