Balík: samtools (1.22.1-1 a iné)

Odkazy pre samtools

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík samtools:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [www.htslib.org]

Podobné balíky:

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, Implementované v: implemented-in::c, interface::commandline, Networking: Klient, Network Protocol: FTP, protocol::http, role::program, Scope: Utility, Sada nástrojov používateľského rozhrania: Ncurses TUI, Purpose: use::analysing, use::calculating, Filtrovanie, Works with: Biologické sekvencie

Ostatné balíky súvisiace s balíkom samtools

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, loong64, sh4]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libhts3t64 (>= 1.17) [ia64]

C library for high-throughput sequencing data formats

dep: libhts3t64 (>= 1.22.1+ds-1) [nie ia64]
dep: libncurses6 (>= 6)

zdieľané knižnice na obsluhu terminálu
dep: libtinfo6 (>= 6)

zdieľaná nízkoúrovňová knižnica terminfo na obsluhu terminálu
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie alpha, armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

komprimačná knižnica - dynamická verzia

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [alpha, armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

sug: cwltool

Common Workflow Language reference implementation

Stiahnuť samtools

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.22.1-1	673.3 kB	1,886.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.22.1-1	680.3 kB	1,495.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.22.1-1	650.1 kB	1,755.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.22.1-1	640.8 kB	1,748.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.22.1-1	645.0 kB	1,556.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.22.1-1	677.6 kB	1,439.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.22.1-1	713.4 kB	1,632.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.19.2-1+b1	716.1 kB	2,112.0 kB	[zoznam súborov]
loong64 (neoficiálny port)	1.22.1-1	666.7 kB	1,814.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.22.1-1	648.3 kB	1,420.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.22.1-1	657.9 kB	1,907.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.22.1-1	693.8 kB	2,011.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.22.1-1	706.9 kB	2,011.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.22.1-1	685.7 kB	1,339.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.22.1-1	683.6 kB	1,555.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.22.1-1	742.2 kB	1,686.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.22.1-1	641.8 kB	7,784.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.22.1-1	683.9 kB	1,460.0 kB	[zoznam súborov]