Paket: mafft (7.525-1 ve diğerleri)

mafft için bağlantılar

Debian Kaynakları:

mafft Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Ana Sayfa [mafft.cbrc.jp]

Benzer paketler:

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

MAFFT is a multiple sequence alignment program which offers three accuracy-oriented methods:

 * L-INS-i (probably most accurate; recommended for <200 sequences;
   iterative refinement method incorporating local pairwise alignment
   information),
 * G-INS-i (suitable for sequences of similar lengths; recommended for
   <200 sequences; iterative refinement method incorporating global
   pairwise alignment information),
 * E-INS-i (suitable for sequences containing large unalignable regions;
   recommended for <200 sequences),

and five speed-oriented methods:

 * FFT-NS-i (iterative refinement method; two cycles only),
 * FFT-NS-i (iterative refinement method; max. 1000 iterations),
 * FFT-NS-2 (fast; progressive method),
 * FFT-NS-1 (very fast; recommended for >2000 sequences; progressive
   method with a rough guide tree),
 * NW-NS-PartTree-1 (recommended for ∼50,000 sequences; progressive
   method with the PartTree algorithm).

Etiketler: Biyoloji: Clustal/ALN, Proteinler, Alan: field::biology, field::biology:bioinformatics, Geliştirildiği dil: implemented-in::c, interface::commandline, Rol: Program, Kapsam: Yardımcı Araç, Amaç: use::comparing, works-with-format::plaintext, Şununla çalışır: Biyolojik Dizi

mafft ile İlgili Diğer Paketler

bağımlılıklar

tavsiye edilen

önerilen

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, loong64, sh4 değil]

GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]

GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

rec: blast2 [ia64]

Paket mevcut değil
rec: libwww-perl

simple and consistent interface to the world-wide web
rec: lynx

classic non-graphical (text-mode) web browser
rec: ncbi-blast+ [ia64 değil]

next generation suite of BLAST sequence search tools
rec: ruby

Interpreter of object-oriented scripting language Ruby (default version)

enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

mafft indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	7.525-1	1.011,8 kB	14.678,0 kB	[dosya listesi]
amd64	7.525-1	1.158,5 kB	13.589,0 kB	[dosya listesi]
arm64	7.525-1	958,1 kB	12.416,0 kB	[dosya listesi]
armel	7.525-1	936,4 kB	12.409,0 kB	[dosya listesi]
armhf	7.525-1	783,4 kB	9.145,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	7.525-1	897,3 kB	11.170,0 kB	[dosya listesi]
i386	7.525-1	1.010,4 kB	13.541,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	7.505-1	1.103,2 kB	24.053,0 kB	[dosya listesi]
loong64 (resmi olmayan port)	7.525-1	970,8 kB	13.369,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	7.525-1	981,4 kB	10.985,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	7.525-1	887,6 kB	14.552,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	7.525-1	1.051,8 kB	17.174,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	7.525-1	1.028,2 kB	16.470,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	7.525-1	1.087,4 kB	9.730,0 kB	[dosya listesi]
s390x	7.525-1	1.059,1 kB	15.720,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	7.525-1	883,0 kB	11.962,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	7.525-1	1.083,5 kB	33.592,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	7.525-1	1.063,3 kB	12.137,0 kB	[dosya listesi]