[ Source: nanopolish ]
Пакунок: nanopolish (0.14.0-2 and others)
Links for nanopolish
Debian Resources:
Download Source Package nanopolish:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
consensus caller for nanopore sequencing data
Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.
Інші пакунки пов'язані з nanopolish
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.23) [sparc64]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.29) [ppc64]
- dep: libc6 (>= 2.38) [not alpha, ia64, loong64, ppc64, sh4, sparc64]
- dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64el, x32]
- Допоміжна бібліотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sparc64]
- Пакунок недоступний
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9) [sparc64]
- Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
- dep: libgomp1 (>= 6) [not sparc64]
-
- dep: libhdf5-100 [sparc64]
- Пакунок недоступний
-
- dep: libhdf5-103-1 [ppc64]
- HDF5 C runtime files - serial version
-
- dep: libhdf5-103-1t64 [ia64]
- HDF5 C runtime files - serial version
-
- dep: libhdf5-310 (>= 1.14.3) [not ia64, ppc64, sparc64]
- HDF5 C runtime files - serial version
-
- dep: libhts2 [sparc64]
- Пакунок недоступний
-
- dep: libhts3 (>= 1.10) [ppc64]
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17) [not ppc64, sparc64]
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libslow5-0 (>= 0.5.1+dfsg) [hppa]
- library for reading & writing SLOW5 files
-
- dep: libslow5-0t64 (>= 0.5.1) [not hppa, ppc64, sparc64]
- library for reading & writing SLOW5 files
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64]
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
- dep: libstdc++6 (>= 14) [not ia64, ppc64, sparc64]
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [sparc64]
- dep: libstdc++6 (>= 9) [ppc64]
-
- dep: libstreamvbyte0 (>= 0.4.1) [not ppc64, sparc64]
- fast integer compression in C using the StreamVByte codec
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: perl [not sparc64]
- Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)
-
- dep: python3 [not sparc64]
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not armel, armhf, hppa, m68k, sh4]
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]
-
- rec: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- rec: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
Завантажити nanopolish
| Архітектура | Версія | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 0.14.0-2 | 2,142.2 kB | 9,861.0 kB | [список файлів] |
| amd64 | 0.14.0-2 | 2,153.9 kB | 9,654.0 kB | [список файлів] |
| arm64 | 0.14.0-2 | 2,080.6 kB | 9,474.0 kB | [список файлів] |
| armel | 0.14.0-2 | 2,085.5 kB | 9,600.0 kB | [список файлів] |
| armhf | 0.14.0-2 | 2,090.9 kB | 9,216.0 kB | [список файлів] |
| hppa (unofficial port) | 0.14.0-2 | 2,145.4 kB | 9,759.0 kB | [список файлів] |
| i386 | 0.14.0-2 | 2,173.9 kB | 9,728.0 kB | [список файлів] |
| ia64 (unofficial port) | 0.14.0-1+b1 | 2,281.9 kB | 10,820.0 kB | [список файлів] |
| loong64 (unofficial port) | 0.14.0-2 | 2,107.9 kB | 9,600.0 kB | [список файлів] |
| m68k (unofficial port) | 0.14.0-2 | 2,120.9 kB | 9,688.0 kB | [список файлів] |
| mips64el | 0.14.0-2 | 2,108.4 kB | 9,845.0 kB | [список файлів] |
| ppc64 (unofficial port) | 0.13.3-2 | 2,208.6 kB | 9,987.0 kB | [список файлів] |
| ppc64el | 0.14.0-2 | 2,154.3 kB | 9,794.0 kB | [список файлів] |
| riscv64 | 0.14.0-2 | 2,145.1 kB | 9,306.0 kB | [список файлів] |
| sh4 (unofficial port) | 0.14.0-2 | 2,236.6 kB | 9,601.0 kB | [список файлів] |
| sparc64 (unofficial port) | 0.5.0-1+b1 | 1,799.8 kB | 3,490.0 kB | [список файлів] |
| x32 (unofficial port) | 0.14.0-2 | 2,154.5 kB | 9,556.0 kB | [список файлів] |