Pakiet: nanopolish (0.14.0-2 i inne)

Odnośniki dla nanopolish

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego nanopolish:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

consensus caller for nanopore sequencing data

Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.

Inne pakiety związane z nanopolish

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.23) [sparc64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.29) [ppc64]

dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, loong64, ppc64, sh4, sparc64]

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64el, x32]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sparc64]

Pakiet niedostępny
dep: libgomp1 (>= 4.9) [sparc64]

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

dep: libgomp1 (>= 6) [nie sparc64]
dep: libhdf5-100 [sparc64]

Pakiet niedostępny
dep: libhdf5-103-1 [ppc64]

HDF5 C runtime files - serial version
dep: libhdf5-103-1t64 [ia64]

HDF5 C runtime files - serial version
dep: libhdf5-310 (>= 1.14.3) [nie ia64, ppc64, sparc64]

HDF5 C runtime files - serial version
dep: libhts2 [sparc64]

Pakiet niedostępny
dep: libhts3 (>= 1.10) [ppc64]

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libhts3t64 (>= 1.17) [nie ppc64, sparc64]

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libslow5-0 (>= 0.5.1+dfsg) [hppa]

library for reading & writing SLOW5 files
dep: libslow5-0t64 (>= 0.5.1) [nie hppa, ppc64, sparc64]

library for reading & writing SLOW5 files
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64]

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

dep: libstdc++6 (>= 14) [nie ia64, ppc64, sparc64]

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [sparc64]

dep: libstdc++6 (>= 9) [ppc64]
dep: libstreamvbyte0 (>= 0.4.1) [nie ppc64, sparc64]

fast integer compression in C using the StreamVByte codec
dep: libunwind8 [ia64]

Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
dep: perl [nie sparc64]

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
dep: python3 [nie sparc64]

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

rec: python3-biopython

Python3 library for bioinformatics
rec: python3-pysam

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

sug: make

Narzędzie do zarządzania procesem kompilacji
sug: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
sug: python [sparc64]

Pakiet niedostępny

Pobieranie nanopolish

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	0.14.0-2	2 142,2 KiB	9 861,0 KiB	[lista plików]
amd64	0.14.0-2	2 153,9 KiB	9 654,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.14.0-2	2 080,6 KiB	9 474,0 KiB	[lista plików]
armel	0.14.0-2	2 085,5 KiB	9 600,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.14.0-2	2 090,9 KiB	9 216,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	0.14.0-2	2 145,4 KiB	9 759,0 KiB	[lista plików]
i386	0.14.0-2	2 173,9 KiB	9 728,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	0.14.0-1+b1	2 281,9 KiB	10 820,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	0.14.0-2	2 107,9 KiB	9 600,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	0.14.0-2	2 120,9 KiB	9 688,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.14.0-2	2 108,4 KiB	9 845,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	0.13.3-2	2 208,6 KiB	9 987,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.14.0-2	2 154,3 KiB	9 794,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.14.0-2	2 145,1 KiB	9 306,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	0.14.0-2	2 236,6 KiB	9 601,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	0.5.0-1+b1	1 799,8 KiB	3 490,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	0.14.0-2	2 154,5 KiB	9 556,0 KiB	[lista plików]