Pakiet: nanopolish (0.14.0-2)

Odnośniki dla nanopolish

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego nanopolish:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

consensus caller for nanopore sequencing data

Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.

Inne pakiety związane z nanopolish

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.38)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie armhf, riscv64]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
dep: libgomp1 (>= 6)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libhdf5-310 (>= 1.14.3)

HDF5 C runtime files - serial version
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libslow5-0t64 (>= 0.5.1)

library for reading & writing SLOW5 files
dep: libstdc++6 (>= 14)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: libstreamvbyte0 (>= 0.4.1)

fast integer compression in C using the StreamVByte codec
dep: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie armhf]

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armhf]

rec: python3-biopython

Python3 library for bioinformatics
rec: python3-pysam

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

sug: make

Narzędzie do zarządzania procesem kompilacji
sug: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

Pobieranie nanopolish

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	2 153,9 KiB	9 654,0 KiB	[lista plików]
arm64	2 080,6 KiB	9 474,0 KiB	[lista plików]
armhf	2 090,9 KiB	9 216,0 KiB	[lista plików]
i386	2 173,9 KiB	9 728,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2 154,3 KiB	9 794,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2 145,1 KiB	9 306,0 KiB	[lista plików]