Balík: nanopolish (0.14.0-2)

Odkazy pre nanopolish

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík nanopolish:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

consensus caller for nanopore sequencing data

Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom nanopolish

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.38)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie armhf, riscv64]

podporná knižnica GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
dep: libgomp1 (>= 6)

podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)
dep: libhdf5-310 (>= 1.14.3)

HDF5 C runtime files - serial version
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libslow5-0t64 (>= 0.5.1)

library for reading & writing SLOW5 files
dep: libstdc++6 (>= 14)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: libstreamvbyte0 (>= 0.4.1)

fast integer compression in C using the StreamVByte codec
dep: perl

Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie armhf]

komprimačná knižnica - dynamická verzia

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armhf]

rec: python3-biopython

Python3 library for bioinformatics
rec: python3-pysam

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

sug: make

nástroj na riadenie kompilácie
sug: perl

Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

Stiahnuť nanopolish

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	2,153.9 kB	9,654.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	2,080.6 kB	9,474.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	2,090.9 kB	9,216.0 kB	[zoznam súborov]
i386	2,173.9 kB	9,728.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	2,154.3 kB	9,794.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	2,145.1 kB	9,306.0 kB	[zoznam súborov]