[ Източник: nanopolish ]
Пакет: nanopolish (0.14.0-2)
Връзки за nanopolish
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник nanopolish.
Отговорници:
Външни препратки:
- Начална страница [github.com]
Подобни пакети:
consensus caller for nanopore sequencing data
Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.
Други пакети, свързани с nanopolish
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [не armhf, riscv64]
- GCC support library
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) support library
-
- dep: libhdf5-310 (>= 1.14.3)
- HDF5 C runtime files - serial version
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libslow5-0t64 (>= 0.5.1)
- library for reading & writing SLOW5 files
-
- dep: libstdc++6 (>= 14)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: libstreamvbyte0 (>= 0.4.1)
- fast integer compression in C using the StreamVByte codec
-
- dep: perl
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [не armhf]
- compression library - runtime
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armhf]
-
- rec: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- rec: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
Изтегляне на nanopolish
| Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|
| amd64 | 2 153,9 кБ | 9 654,0 кБ | [списък на файловете] |
| arm64 | 2 080,6 кБ | 9 474,0 кБ | [списък на файловете] |
| armhf | 2 090,9 кБ | 9 216,0 кБ | [списък на файловете] |
| i386 | 2 173,9 кБ | 9 728,0 кБ | [списък на файловете] |
| ppc64el | 2 154,3 кБ | 9 794,0 кБ | [списък на файловете] |
| riscv64 | 2 145,1 кБ | 9 306,0 кБ | [списък на файловете] |