Package: nanopolish (0.14.0-2)

Links for nanopolish

Debian Resources:

Download Source Package nanopolish:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

Konsensuskalder for nanopore-sekvensdata

Nanoplish bruger en skjult Markovmodel på signalniveau til konsensuskald af nanospores genomsekvensdata. Programmet kan udføre analyse på signalniveau for Oxford Nanopore-sekvensdata. Nanopolish kan beregne en forbedret konsensussekvens for en kladdegenomsamling, registrere baseændringer, kalde SNP'er og indels med respekt for et referencegenom med mere.

Other Packages Related to nanopolish

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.38)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [not armhf, riscv64]

GCC støttebibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
dep: libhdf5-310 (>= 1.14.3)

HDF5 C-kørselstidsfiler - seriel version
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater
dep: libslow5-0t64 (>= 0.5.1)

library for reading & writing SLOW5 files
dep: libstdc++6 (>= 14)

GNU Standard C++ bibliotek v3
dep: libstreamvbyte0 (>= 0.4.1)

Hurtig heltalskompression i C via StreamVByte-kodningen
dep: perl

Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
dep: python3

Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not armhf]

Komprimeringsbibliotek - kørselstid

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armhf]

rec: python3-biopython

Python 3-bibliotek for bioinformatik
rec: python3-pysam

Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

sug: make

Redskab til at dirigere kompileringen
sug: perl

Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

Download nanopolish

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2,153.9 kB	9,654.0 kB	[list of files]
arm64	2,080.6 kB	9,474.0 kB	[list of files]
armhf	2,090.9 kB	9,216.0 kB	[list of files]
i386	2,173.9 kB	9,728.0 kB	[list of files]
ppc64el	2,154.3 kB	9,794.0 kB	[list of files]
riscv64	2,145.1 kB	9,306.0 kB	[list of files]