Paquet : nanopolish (0.14.0-2 et autres)

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Paquets similaires :

identification de consensus pour les données de séquençage par nanopore

Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.

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enhances

dep: libc6 (>= 2.23) [sparc64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.29) [ppc64]

dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, ia64, loong64, ppc64, sh4, sparc64]

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64el, x32]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sparc64]

Paquet indisponible
dep: libgomp1 (>= 4.9) [sparc64]

bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

dep: libgomp1 (>= 6) [non sparc64]
dep: libhdf5-100 [sparc64]

Paquet indisponible
dep: libhdf5-103-1 [ppc64]

HDF5 C runtime files - serial version
dep: libhdf5-103-1t64 [ia64]

HDF5 C runtime files - serial version
dep: libhdf5-310 (>= 1.14.3) [non ia64, ppc64, sparc64]

HDF5 C runtime files - serial version
dep: libhts2 [sparc64]

Paquet indisponible
dep: libhts3 (>= 1.10) [ppc64]

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libhts3t64 (>= 1.17) [non ppc64, sparc64]

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libslow5-0 (>= 0.5.1+dfsg) [hppa]

library for reading & writing SLOW5 files
dep: libslow5-0t64 (>= 0.5.1) [non hppa, ppc64, sparc64]

library for reading & writing SLOW5 files
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 14) [non ia64, ppc64, sparc64]

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [sparc64]

dep: libstdc++6 (>= 9) [ppc64]
dep: libstreamvbyte0 (>= 0.4.1) [non ppc64, sparc64]

fast integer compression in C using the StreamVByte codec
dep: libunwind8 [ia64]

bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
dep: perl [non sparc64]

langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
dep: python3 [non sparc64]

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dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [non armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

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Paquet indisponible

Télécharger nanopolish

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	0.14.0-2	2 142,2 ko	9 861,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	0.14.0-2	2 153,9 ko	9 654,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.14.0-2	2 080,6 ko	9 474,0 ko	[liste des fichiers]
armel	0.14.0-2	2 085,5 ko	9 600,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.14.0-2	2 090,9 ko	9 216,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	0.14.0-2	2 145,4 ko	9 759,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.14.0-2	2 173,9 ko	9 728,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	0.14.0-1+b1	2 281,9 ko	10 820,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	0.14.0-2	2 107,9 ko	9 600,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	0.14.0-2	2 120,9 ko	9 688,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	0.14.0-2	2 108,4 ko	9 845,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	0.13.3-2	2 208,6 ko	9 987,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.14.0-2	2 154,3 ko	9 794,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	0.14.0-2	2 145,1 ko	9 306,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	0.14.0-2	2 236,6 ko	9 601,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	0.5.0-1+b1	1 799,8 ko	3 490,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	0.14.0-2	2 154,5 ko	9 556,0 ko	[liste des fichiers]