[ Paquet source : python-biopython ]
Paquet : python3-biopython (1.85+dfsg-5 et autres)
Liens pour python3-biopython
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source python-biopython :
- [python-biopython_1.85+dfsg-5.dsc]
- [python-biopython_1.85+dfsg.orig.tar.xz]
- [python-biopython_1.85+dfsg-5.debian.tar.xz]
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Charles Plessy (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
- Étienne Mollier (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [biopython.org]
Paquets similaires :
bibliothèque de Python 3 pour la bio-informatique
Le projet Biopython est une association internationale de programmeurs d'outils libres en Python pour la bio-informatique.
C'est une initiative collaborative distribuée pour le développement de bibliothèques et d'applications en Python 3 pour répondre aux besoins des travaux actuels et futurs en bio-informatique. Le code source est disponible sous la licence Biopython qui est extrêmement libérale et compatible avec presque toutes les licences au monde. Le projet travaille avec la Open Bioinformatics Foundation qui fournit généreusement au projet un espace web et CVS.
Autres paquets associés à python3-biopython
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]
- dep: libc6 (>= 2.32) [ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.34) [armel, armhf, m68k]
- dep: libc6 (>= 2.4) [i386, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
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- dep: python3 [non hppa]
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
- dep: python3 (<< 3.13) [alpha, ppc64]
- dep: python3 (<< 3.14) [non alpha, hppa, ppc64, sparc64, x32]
- dep: python3 (<< 3.5) [hppa]
- dep: python3 (<< 3.7) [sparc64]
- dep: python3 (<< 3.9) [x32]
- dep: python3 (>= 3.12~) [alpha, ppc64, sh4]
- dep: python3 (>= 3.13~) [non alpha, hppa, ppc64, sh4, sparc64, x32]
- dep: python3 (>= 3.4~) [hppa]
- dep: python3 (>= 3.5~) [sparc64]
- dep: python3 (>= 3.8~) [x32]
-
- dep: python3-numpy [non alpha, hppa, ppc64, sh4, sparc64, x32]
- bibliothèque de Python pour des calculs numériques – Python 3
- dep: python3-numpy (>= 1:1.10.0~b1) [sparc64]
- dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1) [x32]
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [alpha, ppc64, sh4]
- dep: python3-numpy (>= 1:1.8.0) [hppa]
-
- dep: python3-numpy-abi9 [alpha, hppa, ppc64, sh4, sparc64, x32]
- paquet virtuel fourni par python3-numpy
-
- dep: python3-reportlab [hppa, sparc64, x32]
- bibliothèque ReportLab pour créer des documents PDF en utilisant Python3
- dep: python3-reportlab (>= 4.0.4-1~) [non hppa, sparc64, x32]
-
- dep: w3c-sgml-lib [non hppa, sparc64, x32]
- DTD et fichiers de catalogue de w3.org
-
- rec: ncbi-blast+ [non alpha, x32]
- suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération
- rec: ncbi-blast+ (>= 2.10.0-3) [x32]
- rec: ncbi-blast+ (>= 2.10.1-3) [alpha]
-
- rec: python-biopython-doc (= 1.65+dfsg-1) [hppa]
- documentation pour la bibliothèque Biopython
- rec: python-biopython-doc (= 1.70+dfsg-2) [sparc64]
- rec: python-biopython-doc (= 1.78+dfsg-2) [x32]
- rec: python-biopython-doc (= 1.83+dfsg1-4) [alpha]
- rec: python-biopython-doc (= 1.83+dfsg1-5) [ppc64]
- rec: python-biopython-doc (= 1.84+dfsg-4) [sh4]
- rec: python-biopython-doc (= 1.85+dfsg-4) [m68k]
- rec: python-biopython-doc (= 1.85+dfsg-5) [non alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]
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- sug: bwa [non hppa, sparc64]
- dispositif d'alignement Burrows-Wheeler
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- sug: clustalo
- programme à usage général d'alignement de plusieurs séquences pour les protéines
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- sug: clustalw
- alignement de séquences de nucléotides ou de peptides
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- sug: dialign
- alignement de plusieurs séquences par segments
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- sug: dssp
- assignation de la structure secondaire de la protéine basée sur la structure en 3D
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- sug: emboss
- ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne
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- sug: fasttree
- arbres phylogénétiques à partir d'alignements de nucléotides ou des séquences de protéines
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- sug: mafft
- programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés
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- sug: muscle [hppa, sparc64, x32]
- programme d'alignements multiples de séquences de protéine
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- sug: muscle3 [non hppa, sparc64, x32]
- multiple alignment program of protein sequences
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- sug: phylip [non hppa]
- paquet de programmes pour déduire les phylogénies
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- sug: phyml
- estimation phylogénétique utilisant la probabilité maximale
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- sug: prank
- Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences
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- sug: probcons
- alignement de séquences multiples basé sur la cohérence probabiliste
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- sug: python-mysqldb [hppa, sparc64]
- Paquet indisponible
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- sug: python-reportlab [hppa, sparc64]
- Paquet indisponible
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- sug: python3-igraph [non alpha, hppa, ppc64, sh4, sparc64, x32]
- High performance graph data structures and algorithms (Python 3)
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- sug: python3-matplotlib
- système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab
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- sug: python3-mmtf [non hppa, sparc64]
- encodage binaire de structures biologiques – Python 3
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- sug: python3-mysqldb [non hppa, sparc64]
- interface de Python pour MySQL
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- sug: python3-pil
- Python Imaging Library (Python3)
-
- sug: python3-psycopg2
- Python 3 module for PostgreSQL
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- sug: python3-rdflib [non hppa]
- Python 3 library containing an RDF triple store and RDF parsers/serializers
- sug: python3-rdflib (>= 4) [hppa]
-
- sug: python3-renderpm [hppa, sparc64, x32]
- paquet virtuel fourni par python3-reportlab
-
- sug: python3-scipy [non hppa]
- outils scientifiques pour Python 3
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- sug: python3-tk
- Tkinter –⋅écriture d'applications Tk avec Python⋅3.x
-
- sug: raxml
- ressemblance maximale accélérée aléatoire d'arbres phylogénétiques
-
- sug: samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
-
- sug: t-coffee
- alignement multiple de séquences
-
- sug: w3-dtd-mathml [x32]
- Paquet indisponible
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- sug: wise [non hppa, sparc64]
- comparaison de biopolymères, tels les séquences d'ADN et de protéines
- sug: wise (>= 2.4.1-16) [hppa, sparc64]
Télécharger python3-biopython
| Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|---|
| alpha (portage non officiel) | 1.83+dfsg1-4 | 1 562,6 ko | 11 838,0 ko | [liste des fichiers] |
| amd64 | 1.85+dfsg-5 | 1 635,1 ko | 11 833,0 ko | [liste des fichiers] |
| arm64 | 1.85+dfsg-5 | 1 620,8 ko | 12 288,0 ko | [liste des fichiers] |
| armel | 1.85+dfsg-5 | 1 623,3 ko | 12 337,0 ko | [liste des fichiers] |
| armhf | 1.85+dfsg-5 | 1 607,2 ko | 12 145,0 ko | [liste des fichiers] |
| hppa (portage non officiel) | 1.65+dfsg-1 | 1 119,5 ko | 7 788,0 ko | [liste des fichiers] |
| i386 | 1.85+dfsg-5 | 1 631,2 ko | 11 818,0 ko | [liste des fichiers] |
| loong64 (portage non officiel) | 1.85+dfsg-5 | 1 630,1 ko | 12 286,0 ko | [liste des fichiers] |
| m68k (portage non officiel) | 1.85+dfsg-4 | 1 605,8 ko | 11 739,0 ko | [liste des fichiers] |
| mips64el | 1.85+dfsg-5 | 1 620,0 ko | 12 300,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64 (portage non officiel) | 1.83+dfsg1-5 | 1 582,7 ko | 11 837,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64el | 1.85+dfsg-5 | 1 654,0 ko | 12 352,0 ko | [liste des fichiers] |
| riscv64 | 1.85+dfsg-5 | 1 631,7 ko | 11 694,0 ko | [liste des fichiers] |
| s390x | 1.85+dfsg-5 | 1 651,4 ko | 11 830,0 ko | [liste des fichiers] |
| sh4 (portage non officiel) | 1.84+dfsg-4+b1 | 1 623,4 ko | 13 017,0 ko | [liste des fichiers] |
| sparc64 (portage non officiel) | 1.70+dfsg-2 | 1 139,3 ko | 8 250,0 ko | [liste des fichiers] |
| x32 (portage non officiel) | 1.78+dfsg-2 | 1 365,8 ko | 9 193,0 ko | [liste des fichiers] |