[ Source: nanopolish ]
Пакунок: nanopolish (0.14.0-1)
Links for nanopolish
Debian Resources:
Download Source Package nanopolish:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
consensus caller for nanopore sequencing data
Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.
Інші пакунки пов'язані з nanopolish
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64, arm64, i386, mips64el]
- Допоміжна бібліотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libhdf5-103-1
- HDF5 C runtime files - serial version
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libslow5-0 (>= 0.5.1+dfsg)
- library for reading & writing SLOW5 files
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
-
- dep: libstreamvbyte0 (>= 0.4.1)
- fast integer compression in C using the StreamVByte codec
-
- dep: perl
- Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
-
- rec: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- rec: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
Завантажити nanopolish
| Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|
| amd64 | 2,150.9 kB | 9,355.0 kB | [список файлів] |
| arm64 | 2,084.4 kB | 9,218.0 kB | [список файлів] |
| armel | 2,082.3 kB | 9,345.0 kB | [список файлів] |
| armhf | 2,096.9 kB | 8,961.0 kB | [список файлів] |
| i386 | 2,167.9 kB | 9,441.0 kB | [список файлів] |
| mips64el | 2,110.5 kB | 9,655.0 kB | [список файлів] |
| mipsel | 2,128.5 kB | 9,647.0 kB | [список файлів] |
| ppc64el | 2,159.1 kB | 9,667.0 kB | [список файлів] |