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パッケージ: python3-pairtools (1.1.3-2 など)

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類似のパッケージ:

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations: 

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

その他の python3-pairtools 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • enhances

python3-pairtools のダウンロード

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アーキテクチャ バージョン パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
alpha (非公式の移植版) 1.1.3-2 188.6 kB927.0 kB [ファイル一覧]
amd64 1.1.3-2 203.1 kB840.0 kB [ファイル一覧]
arm64 1.1.3-2 184.4 kB924.0 kB [ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版) 0.3.0-3.2+b2 144.6 kB640.0 kB [ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版) 0.3.0-3.2+b1 137.3 kB612.0 kB [ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版) 1.1.3-2 194.3 kB924.0 kB [ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版) 1.1.2-1 216.9 kB1,096.0 kB [ファイル一覧]
mips64el 1.1.3-2 180.0 kB939.0 kB [ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版) 0.3.0-3.2+b2 146.6 kB752.0 kB [ファイル一覧]
ppc64el 1.1.3-2 196.3 kB988.0 kB [ファイル一覧]
riscv64 1.1.3-2 198.1 kB732.0 kB [ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版) 1.1.2-1 279.6 kB1,312.0 kB [ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版) 0.3.0-3.2+b2 125.9 kB2,292.0 kB [ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版) 0.3.0-3.2+b1 121.6 kB405.0 kB [ファイル一覧]