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Paket: python3-pairtools (1.1.3-2 und andere)

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Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

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loong64 (inoffizielle Portierung) 1.1.3-2 194,3 kB924,0 kB [Liste der Dateien]
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ppc64 (inoffizielle Portierung) 0.3.0-3.2+b2 146,6 kB752,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 1.1.3-2 196,3 kB988,0 kB [Liste der Dateien]
riscv64 1.1.3-2 198,1 kB732,0 kB [Liste der Dateien]
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