Paket: bwa (0.7.19-1 och andra)

Länkar för bwa

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet bwa:

Ansvariga:

Debian Med Packaging Team (QA-sida, E-postarkiv)
Charles Plessy (QA-sida)
Andreas Tille (QA-sida)
Carlos Borroto (QA-sida)
Ognyan Kulev (QA-sida)
Michael R. Crusoe (QA-sida)

Externa resurser:

Hemsida [bio-bwa.sourceforge.net]

Liknande paket:

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Märken: Biologi: Proteiner, Field: Biologi, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, interface::text-mode, role::program, Purpose: Analysing, Comparing

Andra paket besläktade med bwa

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [ej armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Kompressionsbibliotek - körtidspaket

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

rec: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Hämta bwa

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	0.7.19-1	212,2 kbyte	514,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	0.7.19-1	207,6 kbyte	461,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	0.7.19-1	194,0 kbyte	449,0 kbyte	[filförteckning]
armel	0.7.19-1	194,8 kbyte	448,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	0.7.19-1	194,3 kbyte	384,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	0.7.19-1	227,5 kbyte	513,0 kbyte	[filförteckning]
i386	0.7.19-1	231,1 kbyte	520,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	0.7.17-7+b4	280,4 kbyte	925,0 kbyte	[filförteckning]
loong64 (inofficiell anpassning)	0.7.19-1	214,8 kbyte	513,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	0.7.19-1	205,5 kbyte	472,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	0.7.19-1	207,5 kbyte	528,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	0.7.19-1	220,3 kbyte	577,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	0.7.19-1	230,5 kbyte	577,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	0.7.19-1	214,9 kbyte	377,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	0.7.19-1	222,8 kbyte	513,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	0.7.19-1	276,6 kbyte	449,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	0.7.19-1	185,9 kbyte	1.093,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	0.7.19-1	217,9 kbyte	476,0 kbyte	[filförteckning]