Пакет: bwa (0.7.19-1 и другие)

Ссылки для bwa

Ресурсы Debian:

Исходный код bwa:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [bio-bwa.sourceforge.net]

Подобные пакеты:

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Теги: Биология: Протеины, Область: Биология, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Пользовательский интерфейс: Командная строка, interface::text-mode, role::program, Цель: Анализ, Сравнение

Другие пакеты, относящиеся к bwa

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, loong64, sh4]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [не armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

библиотека сжатия

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

rec: perl

практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Загрузка bwa

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	0.7.19-1	212,2 Кб	514,0 Кб	[список файлов]
amd64	0.7.19-1	207,6 Кб	461,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.7.19-1	194,0 Кб	449,0 Кб	[список файлов]
armel	0.7.19-1	194,8 Кб	448,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.7.19-1	194,3 Кб	384,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	0.7.19-1	227,5 Кб	513,0 Кб	[список файлов]
i386	0.7.19-1	231,1 Кб	520,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	0.7.17-7+b4	280,4 Кб	925,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	0.7.19-1	214,8 Кб	513,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	0.7.19-1	205,5 Кб	472,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.7.19-1	207,5 Кб	528,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.7.19-1	220,3 Кб	577,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.7.19-1	230,5 Кб	577,0 Кб	[список файлов]
riscv64	0.7.19-1	214,9 Кб	377,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.7.19-1	222,8 Кб	513,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	0.7.19-1	276,6 Кб	449,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.7.19-1	185,9 Кб	1 093,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	0.7.19-1	217,9 Кб	476,0 Кб	[список файлов]