Paketti: bwa (0.7.19-1 ja muut)

Links for bwa

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti bwa:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [bio-bwa.sourceforge.net]

Samankaltaisia paketteja:

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Tagit: Biology: Proteins, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, interface::text-mode, role::program, Purpose: Analysing, Comparing

Muut pakettiin bwa liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [ei armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

rec: perl

Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten

sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Imuroi bwa

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	0.7.19-1	212.2 kt	514.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	0.7.19-1	207.6 kt	461.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.7.19-1	194.0 kt	449.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.7.19-1	194.8 kt	448.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.7.19-1	194.3 kt	384.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	0.7.19-1	227.5 kt	513.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.7.19-1	231.1 kt	520.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b4	280.4 kt	925.0 kt	[tiedostoluettelo]
loong64 (epävirallinen siirros)	0.7.19-1	214.8 kt	513.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	0.7.19-1	205.5 kt	472.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.7.19-1	207.5 kt	528.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	0.7.19-1	220.3 kt	577.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.7.19-1	230.5 kt	577.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	0.7.19-1	214.9 kt	377.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.7.19-1	222.8 kt	513.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	0.7.19-1	276.6 kt	449.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	0.7.19-1	185.9 kt	1,093.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	0.7.19-1	217.9 kt	476.0 kt	[tiedostoluettelo]