Pakiet: bwa (0.7.19-1 i inne)

Odnośniki dla bwa

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego bwa:

Opiekunowie:

Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
Charles Plessy (Strona QA)
Andreas Tille (Strona QA)
Carlos Borroto (Strona QA)
Ognyan Kulev (Strona QA)
Michael R. Crusoe (Strona QA)

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [bio-bwa.sourceforge.net]

Podobne pakiety:

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Znaczniki: Biologia: Białka, Dziedzina: Biologia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, interface::text-mode, role::program, Przeznaczenie: Analizowanie, Porównywanie

Inne pakiety związane z bwa

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, loong64, sh4]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

rec: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

sug: samtools

Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

Pobieranie bwa

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	0.7.19-1	212,2 KiB	514,0 KiB	[lista plików]
amd64	0.7.19-1	207,6 KiB	461,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.7.19-1	194,0 KiB	449,0 KiB	[lista plików]
armel	0.7.19-1	194,8 KiB	448,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.7.19-1	194,3 KiB	384,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	0.7.19-1	227,5 KiB	513,0 KiB	[lista plików]
i386	0.7.19-1	231,1 KiB	520,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	0.7.17-7+b4	280,4 KiB	925,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	0.7.19-1	214,8 KiB	513,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	0.7.19-1	205,5 KiB	472,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.7.19-1	207,5 KiB	528,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	0.7.19-1	220,3 KiB	577,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.7.19-1	230,5 KiB	577,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.7.19-1	214,9 KiB	377,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.7.19-1	222,8 KiB	513,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	0.7.19-1	276,6 KiB	449,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	0.7.19-1	185,9 KiB	1 093,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	0.7.19-1	217,9 KiB	476,0 KiB	[lista plików]