[ Источник: prime-phylo ]
Пакет: prime-phylo (1.0.11-14 и другие)
Ссылки для prime-phylo
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код prime-phylo:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Erik Sjolund (Страница КК)
- Andreas Tille (Страница КК)
- Étienne Mollier (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [prime.sbc.su.se]
Подобные пакеты:
bayesian estimation of gene trees taking the species tree into account
PrIME (Probabilistic Integrated Models of Evolution) is a package supporting inference of evolutionary parameters in a Bayesian framework using Markov chain Monte Carlo simulation. A distinguishing feature of PrIME is that the species tree is taken into account when analyzing gene trees.
The input data to PrIME is a multiple sequence alignment in FASTA format and the output data contains trees in Newick format.
Другие пакеты, относящиеся к prime-phylo
|
|
|
|
-
- dep: libblas3
- реализация алгоритмов линейной алгебры — библиотека
- или libblas.so.3
- виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libboost-mpi1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]
- C++ interface to the Message Passing Interface (MPI)
-
- dep: libboost-mpi1.83.0 (>= 1.83.0) [не x32]
- C++ interface to the Message Passing Interface (MPI)
-
- dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]
- serialization library for C++
-
- dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0) [не x32]
- serialization library for C++
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [hppa, m68k]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, hppa, ia64, loong64, m68k, sh4]
- dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 15.2.0-4) [loong64]
- вспомогательная библиотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, ppc64el, s390x, x32]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: liblapack3
- библиотека подпрограмм линейной алгебры вер. 3 — динамическая версия
- или liblapack.so.3
- виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]
- high performance message passing library -- shared library
-
- dep: libopenmpi40 (>= 5.0.8) [не hppa, ia64, m68k, sh4, x32]
- high performance message passing library -- shared library
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [hppa, ia64, m68k, sh4]
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
- dep: libstdc++6 (>= 14) [не alpha, hppa, ia64, m68k, sh4]
- dep: libstdc++6 (>= 15.2.0-4) [alpha]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе
-
- dep: libxml2 (>= 2.7.4) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]
- библиотека для работы с XML (GNOME)
-
- dep: libxml2-16 (>= 2.14.1) [не hppa, ia64, m68k, sh4, x32]
- библиотека для работы с XML (GNOME)
-
- dep: perl
- практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
-
- sug: mafft
- Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
-
- sug: mrbayes
- Bayesian Inference of Phylogeny
-
- sug: muscle
- Multiple alignment program of protein sequences
-
- sug: njplot
- phylogenetic tree drawing program
-
- sug: phyml
- Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood
-
- sug: probalign
- multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities
-
- sug: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- sug: raxml
- синтез филогенетических деревьев по методу максимального правдоподобия
-
- sug: treeviewx
- Displays and prints phylogenetic trees
Загрузка prime-phylo
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| alpha (неофициальный перенос) | 1.0.11-14 | 735,8 Кб | 3 598,0 Кб | [список файлов] |
| amd64 | 1.0.11-14 | 814,1 Кб | 3 116,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 1.0.11-14 | 700,0 Кб | 3 255,0 Кб | [список файлов] |
| hppa (неофициальный перенос) | 1.0.11-11 | 818,0 Кб | 3 309,0 Кб | [список файлов] |
| ia64 (неофициальный перенос) | 1.0.11-11 | 892,6 Кб | 5 266,0 Кб | [список файлов] |
| loong64 (неофициальный перенос) | 1.0.11-14 | 760,2 Кб | 3 317,0 Кб | [список файлов] |
| m68k (неофициальный перенос) | 1.0.11-11 | 789,0 Кб | 2 992,0 Кб | [список файлов] |
| mips64el | 1.0.11-14 | 702,6 Кб | 3 639,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64 (неофициальный перенос) | 1.0.11-14 | 793,1 Кб | 4 024,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64el | 1.0.11-14 | 813,4 Кб | 3 767,0 Кб | [список файлов] |
| riscv64 | 1.0.11-14 | 793,1 Кб | 2 467,0 Кб | [список файлов] |
| s390x | 1.0.11-14 | 775,3 Кб | 3 095,0 Кб | [список файлов] |
| sh4 (неофициальный перенос) | 1.0.11-11 | 908,2 Кб | 3 255,0 Кб | [список файлов] |
| sparc64 (неофициальный перенос) | 1.0.11-14 | 635,6 Кб | 13 512,0 Кб | [список файлов] |
| x32 (неофициальный перенос) | 1.0.11-12 | 842,2 Кб | 2 935,0 Кб | [список файлов] |