Paquet : prime-phylo (1.0.11-14 et autres)

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Paquets similaires :

bayesian estimation of gene trees taking the species tree into account

PrIME (Probabilistic Integrated Models of Evolution) is a package supporting inference of evolutionary parameters in a Bayesian framework using Markov chain Monte Carlo simulation. A distinguishing feature of PrIME is that the species tree is taken into account when analyzing gene trees.

The input data to PrIME is a multiple sequence alignment in FASTA format and the output data contains trees in Newick format.

Autres paquets associés à prime-phylo

dépendances

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enhances

dep: libblas3

implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée

ou libblas.so.3

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dep: libboost-mpi1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

interface C++ à l’interface de passage de message (Message Passing Interface –⋅MPI)
dep: libboost-mpi1.83.0 (>= 1.83.0) [non x32]

interface C++ à l’interface de passage de message (Message Passing Interface –⋅MPI)
dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

bibliothèque de sérialisation pour C++
dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0) [non x32]

bibliothèque de sérialisation pour C++
dep: libc6 (>= 2.34) [hppa, m68k]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, hppa, ia64, loong64, m68k, sh4]

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 15.2.0-4) [loong64]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, ppc64el, s390x, x32]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: liblapack3

bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée

ou liblapack.so.3

paquet virtuel fourni par libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

high performance message passing library -- shared library
dep: libopenmpi40 (>= 5.0.8) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

high performance message passing library -- shared library
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [hppa, ia64, m68k, sh4]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 14) [non alpha, hppa, ia64, m68k, sh4]

dep: libstdc++6 (>= 15.2.0-4) [alpha]
dep: libunwind8 [ia64]

bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
dep: libxml2 (>= 2.7.4) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

Bibliothèque XML GNOME
dep: libxml2-16 (>= 2.14.1) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

Bibliothèque XML GNOME
dep: perl

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sug: mafft

programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés
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ressemblance maximale accélérée aléatoire d'arbres phylogénétiques
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Télécharger prime-phylo

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.0.11-14	735,8 ko	3 598,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.0.11-14	814,1 ko	3 116,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.0.11-14	700,0 ko	3 255,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.0.11-11	818,0 ko	3 309,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.0.11-11	892,6 ko	5 266,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	1.0.11-14	760,2 ko	3 317,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.0.11-11	789,0 ko	2 992,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.0.11-14	702,6 ko	3 639,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.0.11-14	793,1 ko	4 024,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.0.11-14	813,4 ko	3 767,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.0.11-14	793,1 ko	2 467,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.0.11-14	775,3 ko	3 095,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.0.11-11	908,2 ko	3 255,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.0.11-14	635,6 ko	13 512,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.0.11-12	842,2 ko	2 935,0 ko	[liste des fichiers]