[ Источник: prime-phylo ]
Пакет: prime-phylo (1.0.11-11)
Ссылки для prime-phylo
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код prime-phylo:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Erik Sjolund (Страница КК)
- Andreas Tille (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [prime.sbc.su.se]
Подобные пакеты:
bayesian estimation of gene trees taking the species tree into account
PrIME (Probabilistic Integrated Models of Evolution) is a package supporting inference of evolutionary parameters in a Bayesian framework using Markov chain Monte Carlo simulation. A distinguishing feature of PrIME is that the species tree is taken into account when analyzing gene trees.
The input data to PrIME is a multiple sequence alignment in FASTA format and the output data contains trees in Newick format.
Другие пакеты, относящиеся к prime-phylo
|
|
|
|
-
- dep: libblas3
- реализация алгоритмов линейной алгебры — библиотека
- или libblas.so.3
- виртуальный пакет, предоставляемый libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libboost-mpi1.83.0 (>= 1.83.0)
- C++ interface to the Message Passing Interface (MPI)
-
- dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0)
- serialization library for C++
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, s390x]
- вспомогательная библиотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]
-
- dep: liblapack3
- библиотека подпрограмм линейной алгебры вер. 3 — динамическая версия
- или liblapack.so.3
- виртуальный пакет, предоставляемый liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)
- high performance message passing library -- shared library
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- dep: libxml2 (>= 2.7.4)
- библиотека для работы с XML (GNOME)
-
- dep: perl
- практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
-
- sug: mafft
- Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
-
- sug: mrbayes
- Bayesian Inference of Phylogeny
-
- sug: muscle
- Multiple alignment program of protein sequences
-
- sug: njplot
- phylogenetic tree drawing program
-
- sug: phyml
- Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood
-
- sug: probalign
- multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities
-
- sug: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- sug: raxml
- синтез филогенетических деревьев по методу максимального правдоподобия
-
- sug: treeviewx
- Displays and prints phylogenetic trees
Загрузка prime-phylo
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| amd64 | 825,5 Кб | 3 220,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 734,7 Кб | 3 379,0 Кб | [список файлов] |
| armel | 695,0 Кб | 2 648,0 Кб | [список файлов] |
| armhf | 707,0 Кб | 2 092,0 Кб | [список файлов] |
| i386 | 884,5 Кб | 3 176,0 Кб | [список файлов] |
| mips64el | 691,4 Кб | 3 788,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64el | 820,6 Кб | 3 891,0 Кб | [список файлов] |
| s390x | 798,7 Кб | 3 247,0 Кб | [список файлов] |