Package: prime-phylo (1.0.11-13 and others)

Links for prime-phylo

Debian Resources:

Download Source Package prime-phylo:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Erik Sjolund (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Étienne Mollier (QA Page)

External Resources:

Homepage [prime.sbc.su.se]

Similar packages:

Bayesiansk estimation af gentræer der tager højde for artstræet

PrIME (Probabilistic Integrated Models of Evolution) er en pakke, der understøtter slutning af evolutionære parametre i en bayesiansk ramme ved hjælp af Markov-kædens Monte Carlo-simulering. Et kendetegn ved PriME er, at artstræet tages i betragtning ved analyse af gentræer.

Inddataene for PrIME er en flersekvenssammenligning i formatet FASTA og resultatet indeholder træer i formatet Newick.

Other Packages Related to prime-phylo

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libblas3

Grundlæggende reference-implementeringer til lineær algebra, delt bibliotek

or libblas.so.3

virtual package provided by libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libboost-mpi1.83.0 (>= 1.83.0)

C++-grænseflade til Message Passing Interface (MPI)
dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0)

Serialiseringsbibliotek for C++
dep: libc6 (>= 2.38)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

GCC støttebibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, riscv64]
dep: liblapack3

Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - delt version

or liblapack.so.3

virtual package provided by liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6)

Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - delt bibliotek
dep: libstdc++6 (>= 14)

GNU Standard C++ bibliotek v3
dep: libxml2 (>= 2.7.4)

XML-bibliotek til GNOME
dep: perl

Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

sug: mafft

Program til justering af flere aminosyrer eller nukleotide sekvenser
sug: mrbayes

Bayesiansk inferens for fylogeni
sug: muscle

Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser
sug: njplot

Fylogenetisk trætegningsprogram
sug: phyml

Fylogenisk estimering der bruger maksimum lIkelihood
sug: probalign

Multiple sekvensjustering med brug partitionsfunktionel posteriore sandsynligheder
sug: python3-biopython

Python 3-bibliotek for bioinformatik
sug: raxml

Randomized Axelerated Maximum Likelihood for pylogenetiske træer
sug: treeviewx

Viser og udskriver fylogenetiske træer

Download prime-phylo

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.0.11-13+b1	825.4 kB	3,160.0 kB	[list of files]
arm64	1.0.11-13+b1	727.5 kB	3,319.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.0.11-13+b1	808.5 kB	3,767.0 kB	[list of files]
riscv64	1.0.11-13+b1	794.1 kB	2,527.0 kB	[list of files]
s390x	1.0.11-13+b1	789.2 kB	3,159.0 kB	[list of files]