[ Source: seqan-raptor ]
Пакунок: seqan-raptor (3.0.1+ds-10 and others)
Links for seqan-raptor
Debian Resources:
Download Source Package seqan-raptor:
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-10.dsc]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds.orig.tar.xz]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-10.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences
Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.
Інші пакунки пов'язані з seqan-raptor
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, loong64]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64, arm64, loong64, ppc64el]
- Допоміжна бібліотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, mips64el, ppc64, riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 12) [ia64]
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ppc64, sparc64]
- dep: libstdc++6 (>= 14) [not ia64, ppc64, sparc64]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: libxxhash0 (>= 0.6.5) [sparc64]
- shared library for xxhash
-
- dep: libyaml-cpp0.7 (>= 0.7.0) [sparc64]
- YAML parser and emitter for C++
-
- dep: libyaml-cpp0.8 (>= 0.7.0) [not ia64, ppc64, sparc64]
- YAML parser and emitter for C++
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
-
- sug: cwl-runner
- virtual package provided by cwltool, toil
Завантажити seqan-raptor
| Архітектура | Версія | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 3.0.1+ds-10 | 621.9 kB | 2,555.0 kB | [список файлів] |
| amd64 | 3.0.1+ds-10 | 706.1 kB | 2,417.0 kB | [список файлів] |
| arm64 | 3.0.1+ds-10 | 602.8 kB | 2,169.0 kB | [список файлів] |
| ia64 (unofficial port) | 2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3 | 695.6 kB | 4,733.0 kB | [список файлів] |
| loong64 (unofficial port) | 3.0.1+ds-10 | 646.9 kB | 2,233.0 kB | [список файлів] |
| mips64el | 3.0.1+ds-10 | 579.0 kB | 2,578.0 kB | [список файлів] |
| ppc64 (unofficial port) | 3.0.0+ds-2 | 458.7 kB | 1,831.0 kB | [список файлів] |
| ppc64el | 3.0.1+ds-10 | 677.4 kB | 2,617.0 kB | [список файлів] |
| riscv64 | 3.0.1+ds-10 | 675.8 kB | 1,701.0 kB | [список файлів] |
| sparc64 (unofficial port) | 3.0.1+ds-2 | 473.3 kB | 2,111.0 kB | [список файлів] |