[ Източник: seqan-raptor ]
Пакет: seqan-raptor (3.0.1+ds-10 и други)
Връзки за seqan-raptor
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник seqan-raptor.
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-10.dsc]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds.orig.tar.xz]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-10.debian.tar.xz]
Отговорници:
Външни препратки:
- Начална страница [github.com]
Подобни пакети:
pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences
Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.
Други пакети, свързани с seqan-raptor
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- high-quality block-sorting file compressor library - runtime
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, loong64]
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64, arm64, loong64, ppc64el]
- GCC support library
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, mips64el, ppc64, riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) support library
-
- dep: libstdc++6 (>= 12) [ia64]
- GNU Standard C++ Library v3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ppc64, sparc64]
- dep: libstdc++6 (>= 14) [не ia64, ppc64, sparc64]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: libxxhash0 (>= 0.6.5) [sparc64]
- shared library for xxhash
-
- dep: libyaml-cpp0.7 (>= 0.7.0) [sparc64]
- YAML parser and emitter for C++
-
- dep: libyaml-cpp0.8 (>= 0.7.0) [не ia64, ppc64, sparc64]
- YAML parser and emitter for C++
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime
-
- sug: cwl-runner
- виртуален пакет, предлаган от cwltool, toil
Изтегляне на seqan-raptor
| Архитектура | Версия | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|---|
| alpha (неофициална архитектура) | 3.0.1+ds-10 | 621,9 кБ | 2 555,0 кБ | [списък на файловете] |
| amd64 | 3.0.1+ds-10 | 706,1 кБ | 2 417,0 кБ | [списък на файловете] |
| arm64 | 3.0.1+ds-10 | 602,8 кБ | 2 169,0 кБ | [списък на файловете] |
| ia64 (неофициална архитектура) | 2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3 | 695,6 кБ | 4 733,0 кБ | [списък на файловете] |
| loong64 (неофициална архитектура) | 3.0.1+ds-10 | 646,9 кБ | 2 233,0 кБ | [списък на файловете] |
| mips64el | 3.0.1+ds-10 | 579,0 кБ | 2 578,0 кБ | [списък на файловете] |
| ppc64 (неофициална архитектура) | 3.0.0+ds-2 | 458,7 кБ | 1 831,0 кБ | [списък на файловете] |
| ppc64el | 3.0.1+ds-10 | 677,4 кБ | 2 617,0 кБ | [списък на файловете] |
| riscv64 | 3.0.1+ds-10 | 675,8 кБ | 1 701,0 кБ | [списък на файловете] |
| sparc64 (неофициална архитектура) | 3.0.1+ds-2 | 473,3 кБ | 2 111,0 кБ | [списък на файловете] |