Pakiet: seqan-raptor (3.0.1+ds-10 i inne)

Odnośniki dla seqan-raptor

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego seqan-raptor:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences

Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.

Inne pakiety związane z seqan-raptor

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libbz2-1.0

Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, loong64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64, arm64, loong64, ppc64el]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, mips64el, ppc64, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
dep: libgomp1 (>= 6)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 12) [ia64]

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ppc64, sparc64]

dep: libstdc++6 (>= 14) [nie ia64, ppc64, sparc64]
dep: libunwind8 [ia64]

Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
dep: libxxhash0 (>= 0.6.5) [sparc64]

Biblioteka współdzielona do xxhash
dep: libyaml-cpp0.7 (>= 0.7.0) [sparc64]

YAML parser and emitter for C++
dep: libyaml-cpp0.8 (>= 0.7.0) [nie ia64, ppc64, sparc64]

YAML parser and emitter for C++
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

sug: cwl-runner

pakiet wirtualny udostępniany przez cwltool, toil

Pobieranie seqan-raptor

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	3.0.1+ds-10	621,9 KiB	2 555,0 KiB	[lista plików]
amd64	3.0.1+ds-10	706,1 KiB	2 417,0 KiB	[lista plików]
arm64	3.0.1+ds-10	602,8 KiB	2 169,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3	695,6 KiB	4 733,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	3.0.1+ds-10	646,9 KiB	2 233,0 KiB	[lista plików]
mips64el	3.0.1+ds-10	579,0 KiB	2 578,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	3.0.0+ds-2	458,7 KiB	1 831,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	3.0.1+ds-10	677,4 KiB	2 617,0 KiB	[lista plików]
riscv64	3.0.1+ds-10	675,8 KiB	1 701,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	3.0.1+ds-2	473,3 KiB	2 111,0 KiB	[lista plików]