Pakiet: seqan-raptor (3.0.1+ds-10)

Odnośniki dla seqan-raptor

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego seqan-raptor:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences

Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.

Inne pakiety związane z seqan-raptor

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libbz2-1.0

Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie riscv64]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
dep: libgomp1 (>= 6)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 14)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: libyaml-cpp0.8 (>= 0.7.0)

YAML parser and emitter for C++
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

sug: cwl-runner

pakiet wirtualny udostępniany przez cwltool, toil

Pobieranie seqan-raptor

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	706,1 KiB	2 417,0 KiB	[lista plików]
arm64	602,8 KiB	2 169,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	677,4 KiB	2 617,0 KiB	[lista plików]
riscv64	675,8 KiB	1 701,0 KiB	[lista plików]