[ ソース: seqan-raptor ]
パッケージ: seqan-raptor (3.0.1+ds-5 など)
seqan-raptor に関するリンク
Debian の資源:
seqan-raptor ソースパッケージをダウンロード:
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-5.dsc]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds.orig.tar.xz]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-5.debian.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences
Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.
その他の seqan-raptor 関連パッケージ
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- dep: libbz2-1.0
- 高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム
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- dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64 以外]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [arm64, ppc64el]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [arm64, ia64, ppc64el, sparc64 以外]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 12) [ia64]
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64 以外]
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- dep: libunwind8 [ia64]
- プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
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- dep: libxxhash0 (>= 0.6.5) [sparc64]
- shared library for xxhash
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- dep: libyaml-cpp0.7 (>= 0.7.0) [sparc64]
- YAML parser and emitter for C++
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- dep: libyaml-cpp0.8 (>= 0.7.0) [ia64, ppc64, sparc64 以外]
- YAML parser and emitter for C++
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
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- sug: cwl-runner
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: cwltool, toil
seqan-raptor のダウンロード
| アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|---|
| alpha (非公式の移植版) | 3.0.1+ds-5 | 579.4 kB | 2,362.0 kB | [ファイル一覧] |
| amd64 | 3.0.1+ds-5 | 646.1 kB | 2,087.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 3.0.1+ds-5 | 551.8 kB | 1,911.0 kB | [ファイル一覧] |
| ia64 (非公式の移植版) | 2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3 | 695.6 kB | 4,733.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 3.0.1+ds-5 | 529.1 kB | 2,319.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64 (非公式の移植版) | 3.0.0+ds-2 | 458.7 kB | 1,831.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 3.0.1+ds-5 | 633.6 kB | 2,359.0 kB | [ファイル一覧] |
| riscv64 | 3.0.1+ds-5+b1 | 620.9 kB | 1,560.0 kB | [ファイル一覧] |
| sparc64 (非公式の移植版) | 3.0.1+ds-2 | 473.3 kB | 2,111.0 kB | [ファイル一覧] |