[ Zdroj: seqan-raptor ]
Balík: seqan-raptor (3.0.1+ds-5 a iné)
Odkazy pre seqan-raptor
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík seqan-raptor:
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-5.dsc]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds.orig.tar.xz]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-5.debian.tar.xz]
Správcovia:
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences
Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom seqan-raptor
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64]
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [arm64, ppc64el]
- podporná knižnica GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [nie arm64, ia64, ppc64el, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 12) [ia64]
- štandardná knižnica C++ GNU v3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie ia64]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory
-
- dep: libxxhash0 (>= 0.6.5) [sparc64]
- shared library for xxhash
-
- dep: libyaml-cpp0.7 (>= 0.7.0) [sparc64]
- YAML parser and emitter for C++
-
- dep: libyaml-cpp0.8 (>= 0.7.0) [nie ia64, ppc64, sparc64]
- YAML parser and emitter for C++
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- komprimačná knižnica - dynamická verzia
-
- sug: cwl-runner
- virtuálny balík poskytovaný balíkom cwltool, toil
Stiahnuť seqan-raptor
| Architektúra | Verzia | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|---|
| alpha (neoficiálny port) | 3.0.1+ds-5 | 579.4 kB | 2,362.0 kB | [zoznam súborov] |
| amd64 | 3.0.1+ds-5 | 646.1 kB | 2,087.0 kB | [zoznam súborov] |
| arm64 | 3.0.1+ds-5 | 551.8 kB | 1,911.0 kB | [zoznam súborov] |
| ia64 (neoficiálny port) | 2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3 | 695.6 kB | 4,733.0 kB | [zoznam súborov] |
| mips64el | 3.0.1+ds-5 | 529.1 kB | 2,319.0 kB | [zoznam súborov] |
| ppc64 (neoficiálny port) | 3.0.0+ds-2 | 458.7 kB | 1,831.0 kB | [zoznam súborov] |
| ppc64el | 3.0.1+ds-5 | 633.6 kB | 2,359.0 kB | [zoznam súborov] |
| riscv64 | 3.0.1+ds-5+b1 | 620.9 kB | 1,560.0 kB | [zoznam súborov] |
| sparc64 (neoficiálny port) | 3.0.1+ds-2 | 473.3 kB | 2,111.0 kB | [zoznam súborov] |