Пакунок: seqan-raptor (3.0.1+ds-5)

Links for seqan-raptor

Debian Resources:

Download Source Package seqan-raptor:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences

Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.

Інші пакунки пов'язані з seqan-raptor

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libbz2-1.0

Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль
dep: libc6 (>= 2.34)

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [arm64, ppc64el]

Допоміжна бібліотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el]
dep: libgomp1 (>= 6)

Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
dep: libyaml-cpp0.8 (>= 0.7.0)

YAML parser and emitter for C++
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

sug: cwl-runner

virtual package provided by cwltool, toil

Завантажити seqan-raptor

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	646.1 kB	2,087.0 kB	[список файлів]
arm64	551.8 kB	1,911.0 kB	[список файлів]
mips64el	529.1 kB	2,319.0 kB	[список файлів]
ppc64el	633.6 kB	2,359.0 kB	[список файлів]