[ Source: pairtools ]
Package: python3-pairtools (1.0.3-1)
Links for python3-pairtools
Debian Resources:
Download Source Package pairtools:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
infrastruttura per elaborare dati di sequenziamento da un esperimento Hi-C
Semplice e veloce infrastruttura a riga di comando per elaborare dati di sequenziamento da un esperimento Hi-C.
Elabora allineamenti di sequenze a terminali appaiati ed effettua le seguenti operazioni:
- rileva giunzioni di legatura (alias coppie Hi-C) in sequenze allineate, a terminali accoppiati, di molecole di DNA Hi-C; - ordina file .pairs per analisi successive; - rileva, applica tag e rimuove duplicati di PCR/ottici; - genera statistiche esaurienti su insiemi di dati Hi-C; - seleziona coppie Hi-C in base a criteri definiti in modo flessibile; - ripristina allineamenti .sam da coppie Hi-C.
Other Packages Related to python3-pairtools
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
-
- dep: python3
- linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)
- dep: python3 (<< 3.13)
- dep: python3 (>= 3.11~)
-
- dep: python3-bioframe
- library to enable flexible, scalable operations on genomic interval dataframes
-
- dep: python3-click
- wrapper di optparse per utilità a riga di comando - Python 3.x
-
- dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0)
- veloce funzionalità per array per il linguaggio Python (Python 3)
-
- dep: python3-numpy-abi9
- virtual package provided by python3-numpy
-
- dep: python3-pandas
- strutture dati per dati "relazionali" o "etichettati"
-
- dep: python3-pysam (>= 0.20.0+ds-3~)
- interfaccia al formato SAM/BAM per allineamento e mappatura di sequenze (Python 3)
-
- dep: python3-scipy
- strumenti scientifici per Python 3
-
- dep: python3-yaml
- analizzatore ed emettitore YAML per Python 3
-
- sug: python3-pairtools-examples (>= 1.0.2)
- infrastruttura per elaborare dati di sequenziamento da un esperimento Hi-C (esempi)
Download python3-pairtools
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 226.4 kB | 1,021.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 202.3 kB | 1,043.0 kB | [list of files] |
| armel | 199.0 kB | 903.0 kB | [list of files] |
| armhf | 203.9 kB | 763.0 kB | [list of files] |
| i386 | 226.5 kB | 1,007.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 194.3 kB | 1,191.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 217.0 kB | 1,171.0 kB | [list of files] |