Paquet : flye (2.9.6+dfsg-1 et autres)

Liens pour flye

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Paquets similaires :

assembleur de novo pour les lectures de séquençage de molécule unique utilisant un graphe de répétitions

Flye est un assembleur de novo pour les lectures de séquençage de molécule unique, telles que celles produites par PacBio et « Oxford Nanopore Technologies ». Il est conçu pour une large diversité d’ensembles de données, du petit projet concernant des bactéries aux assemblages à l’échelle de mammifères. Ce paquet constitue une chaine complète : il prend en entrée des chaines brutes de PacBio ou ONT et produit des contigs propres. Flye possède aussi un mode spécial pour les assemblages de métagénome.

Autres paquets associés à flye

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, ia64, loong64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non alpha, ia64, riscv64]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 14) [non ia64]
dep: libunwind8 [ia64]

bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
dep: minimap2

versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences
dep: python3

langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
dep: python3-six

bibliothèque de compatibilité Python 2 et 3 – interface Python⋅3
dep: samtools

traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger flye

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.9.6+dfsg-1	22 611,2 ko	37 054,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.9.6+dfsg-1	22 656,0 ko	36 932,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.9.6+dfsg-1	22 576,1 ko	36 731,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2.9.3+dfsg2-1	22 763,6 ko	38 428,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	2.9.6+dfsg-1	22 603,3 ko	36 795,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.9.6+dfsg-1	22 580,3 ko	37 035,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2.9.6+dfsg-1	22 637,7 ko	37 179,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.9.6+dfsg-1	22 648,5 ko	37 115,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.9.6+dfsg-1	22 634,8 ko	36 479,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2.9.6+dfsg-1	22 685,6 ko	37 087,0 ko	[liste des fichiers]