Пакет: flye (2.9.6+dfsg-1 и другие)

Ссылки для flye

Ресурсы Debian:

Исходный код flye:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

de novo assembler for single molecule sequencing reads using repeat graphs

Flye is a de novo assembler for single molecule sequencing reads, such as those produced by PacBio and Oxford Nanopore Technologies. It is designed for a wide range of datasets, from small bacterial projects to large mammalian-scale assemblies. The package represents a complete pipeline: it takes raw PacBio / ONT reads as input and outputs polished contigs. Flye also has a special mode for metagenome assembly.

Другие пакеты, относящиеся к flye

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, loong64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не alpha, ia64, riscv64]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64]

стандартная библиотека GNU C++ версии 3

dep: libstdc++6 (>= 14) [не ia64]
dep: libunwind8 [ia64]

библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе
dep: minimap2

versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences
dep: python3

интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)
dep: python3-six

Python 2 and 3 compatibility library
dep: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

библиотека сжатия

Загрузка flye

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	2.9.6+dfsg-1	22 611,2 Кб	37 054,0 Кб	[список файлов]
amd64	2.9.6+dfsg-1	22 656,0 Кб	36 932,0 Кб	[список файлов]
arm64	2.9.6+dfsg-1	22 576,1 Кб	36 731,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	2.9.3+dfsg2-1	22 763,6 Кб	38 428,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	2.9.6+dfsg-1	22 603,3 Кб	36 795,0 Кб	[список файлов]
mips64el	2.9.6+dfsg-1	22 580,3 Кб	37 035,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	2.9.6+dfsg-1	22 637,7 Кб	37 179,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	2.9.6+dfsg-1	22 648,5 Кб	37 115,0 Кб	[список файлов]
riscv64	2.9.6+dfsg-1	22 634,8 Кб	36 479,0 Кб	[список файлов]
s390x	2.9.6+dfsg-1	22 685,6 Кб	37 087,0 Кб	[список файлов]