Paketti: flye (2.9.6+dfsg-1 ja muut)

Links for flye

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti flye:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

de novo assembler for single molecule sequencing reads using repeat graphs

Flye is a de novo assembler for single molecule sequencing reads, such as those produced by PacBio and Oxford Nanopore Technologies. It is designed for a wide range of datasets, from small bacterial projects to large mammalian-scale assemblies. The package represents a complete pipeline: it takes raw PacBio / ONT reads as input and outputs polished contigs. Flye also has a special mode for metagenome assembly.

Muut pakettiin flye liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [ei alpha, ia64, loong64]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei alpha, ia64, riscv64]

GCC:n apukirjasto

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64]

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

dep: libstdc++6 (>= 14) [ei ia64]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: minimap2

versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: python3-six

Python 2 and 3 compatibility library
dep: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi flye

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	2.9.6+dfsg-1	22,611.2 kt	37,054.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	2.9.6+dfsg-1	22,656.0 kt	36,932.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	2.9.6+dfsg-1	22,576.1 kt	36,731.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	2.9.3+dfsg2-1	22,763.6 kt	38,428.0 kt	[tiedostoluettelo]
loong64 (epävirallinen siirros)	2.9.6+dfsg-1	22,603.3 kt	36,795.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	2.9.6+dfsg-1	22,580.3 kt	37,035.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	2.9.6+dfsg-1	22,637.7 kt	37,179.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	2.9.6+dfsg-1	22,648.5 kt	37,115.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	2.9.6+dfsg-1	22,634.8 kt	36,479.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	2.9.6+dfsg-1	22,685.6 kt	37,087.0 kt	[tiedostoluettelo]