[ Paquet source : flye ]
Paquet : flye (2.9.1+dfsg-1)
Liens pour flye
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source flye :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
assembleur de novo pour les lectures de séquençage de molécule unique utilisant un graphe de répétitions
Flye est un assembleur de novo pour les lectures de séquençage de molécule unique, telles que celles produites par PacBio et « Oxford Nanopore Technologies ». Il est conçu pour une large diversité d’ensembles de données, du petit projet concernant des bactéries aux assemblages à l’échelle de mammifères. Ce paquet constitue une chaine complète : il prend en entrée des chaines brutes de PacBio ou ONT et produit des contigs propres. Flye possède aussi un mode spécial pour les assemblages de métagénome.
Autres paquets associés à flye
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libstdc++6 (>= 11)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: minimap2
- versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
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- dep: samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Bibliothèque de compression - binaires
Télécharger flye
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| amd64 | 22 627,0 ko | 36 881,0 ko | [liste des fichiers] |
| arm64 | 22 552,7 ko | 36 701,0 ko | [liste des fichiers] |
| mips64el | 22 556,1 ko | 37 072,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64el | 22 634,7 ko | 37 149,0 ko | [liste des fichiers] |
| s390x | 22 582,3 ko | 36 993,0 ko | [liste des fichiers] |