[ Paquet source : sourmash ]
Paquet : sourmash (4.8.14-3 et autres)
Liens pour sourmash
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source sourmash :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Michael R. Crusoe (Page QA)
- Debian Rust Maintainers (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
tools for comparing DNA sequences with MinHash sketches
Compute MinHash signatures for nucleotide (DNA/RNA) and protein sequences.
MinHash sketches provide a lightweight way to store “signatures” of large DNA or RNA sequence collections, and then compare or search them using a Jaccard index. MinHash sketches can be used to identify samples, find similar samples, identify data sets with shared sequences, and build phylogenetic trees (Ondov et al. 2015).
sourmash provides a command line script, a Python library, and a CPython module for MinHash sketches.
These tools provide functionality previously handled by the 'khmer' package.
Autres paquets associés à sourmash
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: librocksdb9.10 (>= 9.10.0)
- persistent Key-Value Store for Flash and RAM Storage
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
- dep: python3 (>= 3~)
-
- dep: python3-bitstring
- Python module for manipulation of binary data (Python 3)
-
- dep: python3-cachetools
- extensible memoizing collections and decorators for Python 3
-
- dep: python3-cffi-backend-api-max (>= 9729)
- Paquet indisponible
-
- dep: python3-cffi-backend-api-min (<= 9729)
- Paquet indisponible
-
- dep: python3-deprecation
- Library to handle automated deprecations
-
- dep: python3-matplotlib
- système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab
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- dep: python3-numpy
- bibliothèque de Python pour des calculs numériques – Python 3
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- dep: python3-scipy
- outils scientifiques pour Python 3
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- dep: python3-screed
- short nucleotide read sequence utils in Python 3
Télécharger sourmash
| Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 4.8.14-3+b1 | 718,1 ko | 2 498,0 ko | [liste des fichiers] |
| arm64 | 4.8.14-3+b1 | 652,3 ko | 2 394,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64el | 4.8.14-3+b1 | 715,2 ko | 2 714,0 ko | [liste des fichiers] |
| riscv64 | 4.8.14-3+b1 | 693,7 ko | 2 283,0 ko | [liste des fichiers] |