[ Source: sourmash ]
Package: sourmash (4.8.14-3 and others)
Links for sourmash
Debian Resources:
Download Source Package sourmash:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
- Debian Rust Maintainers (QA Page)
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Værktøjer til at sammenligne DNA-sekvenser med MinHash-skitser
Beregn MinHash-signaturer for nukleotid- (DNA/RNA) og proteinsekvenser.
MinHash-tegninger tilbyder en simpel måde at lagre »signaturer« for store DNA- eller RNA-sekvenssamlinger og så sammenligne eller søge i dem via et Jaccard-indeks. MinHash-tegninger kan bruges til at identificere prøver, finde lignende prøver, identificere datasæt med delte sekvenser og bygge fylogenetiske træer (Ondov et al. 2015).
Sourmash tilbyder et kommandolinjeskript, et Pythonbibliotek og et CPython-modul for MinHash-skitser.
Disse værktøjer tilbyder funktionalitet tidligere håndteret af pakken khmer.
Other Packages Related to sourmash
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: librocksdb9.10 (>= 9.10.0)
- persistent Key-Value Store for Flash and RAM Storage
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
- dep: python3 (>= 3~)
-
- dep: python3-bitstring
- Pythonmodul til at manipulere binære data - Python 3
-
- dep: python3-cachetools
- Udvidelige memoizingsamlinger og dekoratører til Python 3
-
- dep: python3-cffi-backend-api-max (>= 9729)
- Package not available
-
- dep: python3-cffi-backend-api-min (<= 9729)
- Package not available
-
- dep: python3-deprecation
- Library to handle automated deprecations
-
- dep: python3-matplotlib
- Pythonbaseret plotsystem i en stil der ligner Matlab
-
- dep: python3-numpy
- Pythonbibliotek til numeriske beregninger - Python 3
-
- dep: python3-scipy
- Videnskabelige værktøjer for Python 3
-
- dep: python3-screed
- Korte nukleotide læsesekvensredskaber i Python 3
Download sourmash
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 4.8.14-3+b1 | 718.1 kB | 2,498.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 4.8.14-3+b1 | 652.3 kB | 2,394.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 4.8.14-3+b1 | 715.2 kB | 2,714.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 4.8.14-3+b1 | 693.7 kB | 2,283.0 kB | [list of files] |