[ Източник: sourmash ]
Пакет: sourmash (4.8.14-3 и други)
Връзки за sourmash
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник sourmash.
Отговорници:
- Debian Med Packaging Team (Страница за QA, Пощенски архив)
- Michael R. Crusoe (Страница за QA)
- Debian Rust Maintainers (Страница за QA)
Външни препратки:
- Начална страница [github.com]
Подобни пакети:
tools for comparing DNA sequences with MinHash sketches
Compute MinHash signatures for nucleotide (DNA/RNA) and protein sequences.
MinHash sketches provide a lightweight way to store “signatures” of large DNA or RNA sequence collections, and then compare or search them using a Jaccard index. MinHash sketches can be used to identify samples, find similar samples, identify data sets with shared sequences, and build phylogenetic trees (Ondov et al. 2015).
sourmash provides a command line script, a Python library, and a CPython module for MinHash sketches.
These tools provide functionality previously handled by the 'khmer' package.
Други пакети, свързани с sourmash
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- GCC support library
-
- dep: librocksdb9.10 (>= 9.10.0)
- persistent Key-Value Store for Flash and RAM Storage
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (>= 3~)
-
- dep: python3-bitstring
- Python module for manipulation of binary data (Python 3)
-
- dep: python3-cachetools
- extensible memoizing collections and decorators for Python 3
-
- dep: python3-cffi-backend-api-max (>= 9729)
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-cffi-backend-api-min (<= 9729)
- Пакетът не е наличен
-
- dep: python3-deprecation
- Library to handle automated deprecations
-
- dep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab
-
- dep: python3-numpy
- Python library for numerical computations (Python 3)
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: python3-screed
- short nucleotide read sequence utils in Python 3
Изтегляне на sourmash
| Архитектура | Версия | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 4.8.14-3+b1 | 718,1 кБ | 2 498,0 кБ | [списък на файловете] |
| arm64 | 4.8.14-3+b1 | 652,3 кБ | 2 394,0 кБ | [списък на файловете] |
| ppc64el | 4.8.14-3+b1 | 715,2 кБ | 2 714,0 кБ | [списък на файловете] |
| riscv64 | 4.8.14-3+b1 | 693,7 кБ | 2 283,0 кБ | [списък на файловете] |