[ Zdroj: sourmash ]
Balík: sourmash (4.9.4-3 a iné)
Odkazy pre sourmash
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík sourmash:
Správcovia:
- Debian Med Packaging Team (Stránka QA, Konferencia)
- Michael R. Crusoe (Stránka QA)
- Debian Rust Maintainers (Stránka QA)
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
tools for comparing DNA sequences with MinHash sketches
Compute MinHash signatures for nucleotide (DNA/RNA) and protein sequences.
MinHash sketches provide a lightweight way to store “signatures” of large DNA or RNA sequence collections, and then compare or search them using a Jaccard index. MinHash sketches can be used to identify samples, find similar samples, identify data sets with shared sequences, and build phylogenetic trees (Ondov et al. 2015).
sourmash provides a command line script, a Python library, and a CPython module for MinHash sketches.
These tools provide functionality previously handled by the 'khmer' package.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom sourmash
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [nie loong64, ppc64el]
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.39) [ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- podporná knižnica GCC
-
- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- komprimačná knižnica formátu XZ
-
- dep: librocksdb9.10 (>= 9.10.0)
- persistent Key-Value Store for Flash and RAM Storage
-
- dep: libzstd1 (>= 1.5.5)
- rýchly bezstratový komprimačný algoritmus
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (>= 3~)
-
- dep: python3-bitstring
- Python module for manipulation of binary data (Python 3)
-
- dep: python3-cachetools
- extensible memoizing collections and decorators for Python 3
-
- dep: python3-cffi-backend-api-max (>= 9729)
- Balík nie je dostupný
-
- dep: python3-cffi-backend-api-min (<= 9729)
- Balík nie je dostupný
-
- dep: python3-deprecation
- Library to handle automated deprecations
-
- dep: python3-matplotlib
- systém v Pythone na vykresľovanie v štýle podobnom Matlabu
-
- dep: python3-numpy
- Python library for numerical computations (Python 3)
-
- dep: python3-scipy
- vedecké nástroje pre Python 3
-
- dep: python3-screed
- short nucleotide read sequence utils in Python 3
Stiahnuť sourmash
| Architektúra | Verzia | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 4.9.4-3 | 825.9 kB | 2,824.0 kB | [zoznam súborov] |
| arm64 | 4.9.4-3 | 747.2 kB | 2,684.0 kB | [zoznam súborov] |
| loong64 (neoficiálny port) | 4.9.4-2 | 753.9 kB | 2,876.0 kB | [zoznam súborov] |
| mips64el | 4.9.4-3 | 801.0 kB | 3,409.0 kB | [zoznam súborov] |
| ppc64el | 4.9.4-3 | 822.1 kB | 3,132.0 kB | [zoznam súborov] |
| riscv64 | 4.9.4-3 | 804.1 kB | 2,589.0 kB | [zoznam súborov] |