[ Источник: sourmash ]
Пакет: sourmash (4.9.4-3 и другие)
Ссылки для sourmash
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код sourmash:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Michael R. Crusoe (Страница КК)
- Debian Rust Maintainers (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
tools for comparing DNA sequences with MinHash sketches
Compute MinHash signatures for nucleotide (DNA/RNA) and protein sequences.
MinHash sketches provide a lightweight way to store “signatures” of large DNA or RNA sequence collections, and then compare or search them using a Jaccard index. MinHash sketches can be used to identify samples, find similar samples, identify data sets with shared sequences, and build phylogenetic trees (Ondov et al. 2015).
sourmash provides a command line script, a Python library, and a CPython module for MinHash sketches.
These tools provide functionality previously handled by the 'khmer' package.
Другие пакеты, относящиеся к sourmash
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [не loong64, ppc64el]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.39) [ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- библиотека для работы с архивами в формате XZ
-
- dep: librocksdb9.10 (>= 9.10.0)
- persistent Key-Value Store for Flash and RAM Storage
-
- dep: libzstd1 (>= 1.5.5)
- быстрый алгоритм сжатия без потерь
-
- dep: python3
- интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)
- dep: python3 (>= 3~)
-
- dep: python3-bitstring
- Python module for manipulation of binary data (Python 3)
-
- dep: python3-cachetools
- extensible memoizing collections and decorators for Python 3
-
- dep: python3-cffi-backend-api-max (>= 9729)
- Пакет недоступен
-
- dep: python3-cffi-backend-api-min (<= 9729)
- Пакет недоступен
-
- dep: python3-deprecation
- Library to handle automated deprecations
-
- dep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab
-
- dep: python3-numpy
- Python library for numerical computations (Python 3)
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: python3-screed
- short nucleotide read sequence utils in Python 3
Загрузка sourmash
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 4.9.4-3 | 825,9 Кб | 2 824,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 4.9.4-3 | 747,2 Кб | 2 684,0 Кб | [список файлов] |
| loong64 (неофициальный перенос) | 4.9.4-2 | 753,9 Кб | 2 876,0 Кб | [список файлов] |
| mips64el | 4.9.4-3 | 801,0 Кб | 3 409,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64el | 4.9.4-3 | 822,1 Кб | 3 132,0 Кб | [список файлов] |
| riscv64 | 4.9.4-3 | 804,1 Кб | 2 589,0 Кб | [список файлов] |