[ Zdroj: ampliconnoise ]
Balík: ampliconnoise (1.29-16 a iné)
Odkazy pre ampliconnoise
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík ampliconnoise:
Správcovia:
- Debian Med Packaging Team (Stránka QA, Konferencia)
- Andreas Tille (Stránka QA)
- Pranav Ballaney (Stránka QA)
- Étienne Mollier (Stránka QA)
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
removal of noise from 454 sequenced PCR amplicons
AmpliconNoise is a package of applications to clean up high-throughput sequence data. It consists of three main parts:
Pyronoise - does flowgram-based clustering to spot misreads SeqNoise - removes PCR point mutations Perseus - removes PCR chimeras without the need for a set of reference sequences
Previously there was a standalone "Pyronoise" by the same authors and this package includes an updated version. There is also a "Denoiser" in Qiime which is related but distinct.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom ampliconnoise
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [x32]
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, loong64, sh4, x32]
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
-
- dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [ia64]
- GNU Scientific Library (GSL) - balík knižnice
-
- dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg) [nie ia64]
- GNU Scientific Library (GSL) - balík knižnice
-
- dep: libmpich12 [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]
- Shared libraries for MPICH
- dep: libmpich12 (>= 4.2.0) [x32]
-
- dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [ia64]
- knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica
-
- dep: libopenmpi40 (>= 5.0.8) [nie armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4, x32]
- knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica
-
- dep: mafft
- Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
-
- rec: mpi-default-bin [nie ia64]
- štandardné dynamické programy MPI - metabalík
-
- rec: openmpi-bin [ia64]
- knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - spustiteľné súbory
Stiahnuť ampliconnoise
| Architektúra | Verzia | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|---|
| alpha (neoficiálny port) | 1.29-16 | 1,077.3 kB | 2,527.0 kB | [zoznam súborov] |
| amd64 | 1.29-16 | 1,085.6 kB | 2,055.0 kB | [zoznam súborov] |
| arm64 | 1.29-16 | 1,075.0 kB | 2,399.0 kB | [zoznam súborov] |
| armel | 1.29-16 | 1,064.1 kB | 2,386.0 kB | [zoznam súborov] |
| armhf | 1.29-16 | 1,058.9 kB | 2,386.0 kB | [zoznam súborov] |
| hppa (neoficiálny port) | 1.29-16 | 1,065.1 kB | 1,930.0 kB | [zoznam súborov] |
| i386 | 1.29-16 | 1,081.8 kB | 2,054.0 kB | [zoznam súborov] |
| ia64 (neoficiálny port) | 1.29-11 | 1,096.8 kB | 2,314.0 kB | [zoznam súborov] |
| loong64 (neoficiálny port) | 1.29-16 | 1,081.8 kB | 2,527.0 kB | [zoznam súborov] |
| m68k (neoficiálny port) | 1.29-16 | 1,054.2 kB | 1,930.0 kB | [zoznam súborov] |
| mips64el | 1.29-16 | 1,072.7 kB | 2,421.0 kB | [zoznam súborov] |
| ppc64 (neoficiálny port) | 1.29-16 | 1,087.2 kB | 2,591.0 kB | [zoznam súborov] |
| ppc64el | 1.29-16 | 1,097.3 kB | 2,591.0 kB | [zoznam súborov] |
| riscv64 | 1.29-16 | 1,079.1 kB | 1,907.0 kB | [zoznam súborov] |
| s390x | 1.29-16 | 1,096.0 kB | 2,099.0 kB | [zoznam súborov] |
| sh4 (neoficiálny port) | 1.29-15 | 1,082.6 kB | 2,386.0 kB | [zoznam súborov] |
| sparc64 (neoficiálny port) | 1.29-16 | 1,066.1 kB | 14,890.0 kB | [zoznam súborov] |
| x32 (neoficiálny port) | 1.29-15 | 1,079.1 kB | 2,006.0 kB | [zoznam súborov] |