Пакет: python-cyvcf2 (0.10.4-1)

Ссылки для python-cyvcf2

Ресурсы Debian:

Исходный код cyvcf2:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

VCF parser based on htslib (Python 2)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 2.

Другие пакеты, относящиеся к python-cyvcf2

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libbz2-1.0

библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)
dep: libc6 (>= 2.17)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libcurl3-gnutls (>= 7.16.2)

удобная библиотека для передачи данных клиента по URL (GnuTLS)
dep: libhts2 (>= 1.2.1)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809)

библиотека для работы с архивами в формате XZ
dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

инструментарий Secure Sockets Layer — разделяемые библиотеки
dep: python

интерактивный объектно-ориентированный язык высокого уровня (ветка 2.x)

dep: python (<< 2.8)

dep: python (>= 2.7~)
dep: python-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

быстрые методы работы с числовыми массивами – модуль для языка Python
dep: python-numpy-abi9

виртуальный пакет, предоставляемый python-numpy
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

библиотека сжатия

sug: python-cyvcf2-doc

Пакет недоступен

Загрузка python-cyvcf2

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
arm64	734,6 Кб	4 524,0 Кб	[список файлов]