Paquet : python-cyvcf2 (0.10.4-1)

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Paquets similaires :

VCF parser based on htslib (Python 2)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 2.

Autres paquets associés à python-cyvcf2

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libbz2-1.0

Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)
dep: libc6 (>= 2.17)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libcurl3-gnutls (>= 7.16.2)

bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec GnuTLS
dep: libhts2 (>= 1.2.1)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809)

librairie de compression au format XZ
dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

trousse à outils SSL - bibliothèques partagées
dep: python

langage interactif de haut niveau orienté objet (version Python2)

dep: python (<< 2.8)

dep: python (>= 2.7~)
dep: python-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

gestion rapide des tableaux avec Python
dep: python-numpy-abi9

paquet virtuel fourni par python-numpy
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Bibliothèque de compression - binaires

sug: python-cyvcf2-doc

Paquet indisponible

Télécharger python-cyvcf2

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
arm64	734,6 ko	4 524,0 ko	[liste des fichiers]