[ buster ]
[ ソース: cyvcf2 ]
パッケージ: python-cyvcf2 (0.10.4-1)
python-cyvcf2 に関するリンク
Debian の資源:
cyvcf2 ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
VCF parser based on htslib (Python 2)
This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.
cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.
This package installs the library for Python 2.
その他の python-cyvcf2 関連パッケージ
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- dep: libbz2-1.0
- 高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム
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- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libcurl3-gnutls (>= 7.16.2)
- 使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (GnuTLS フレーバ)
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- dep: libhts2 (>= 1.2.1)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809)
- XZ 形式の圧縮ライブラリ
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- dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)
- Secure Sockets Layer ツールキット - 共有ライブラリ
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- dep: python
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (Python2 バージョン)
- dep: python (<< 2.8)
- dep: python (>= 2.7~)
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- dep: python-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)
- Numerical Python - Python 言語に高速な配列操作機能を追加
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- dep: python-numpy-abi9
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python-numpy
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
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- sug: python-cyvcf2-doc
- パッケージは利用できません