[ Source: spaln ]
Package: spaln (3.0.2+dfsg-2 and others)
Links for spaln
Debian Resources:
Download Source Package spaln:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Opdelingsparat transkript-sammenligning til genomisk DNA
Spaln (space-efficient spliced alignment) er et uafhængigt program, der kortlægger og sammenligner et sæt af cDNA- eller proteinsekvenser til en hel genomisk sekvens i et enkelt job. Udfører også opdelt eller ordinær sammenligning efter hurtig lighedssøgning mod en proteinsekvensdatabase, hvis et genomisk segment eller en amino-syresekvens er angivet i en forespørgsel.
Spaln understøtter en kombination af proteinsekvensdatabase og et angivet genomisk segment og udfører hurtige lighedssøgninger og (semi-)global sammenligning af et sæt af proteinsekvensforespørgsler mod en proteinsekvensdatabase. Spaln adopterer flerfase heuristik, der gør det muligt at udføre jobbet på en konventionel personlig computer.
Other Packages Related to spaln
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.33) [hppa, m68k, sh4, x32]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [not hppa, ia64, m68k, riscv64, sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [not hppa, m68k, sh4, x32]
- GNU Scientific Library (GSL) - bibliotekspakke
-
- dep: libgslcblas0 (>= 2.7.1) [sparc64]
- GNU Scientific Library (GSL) - blas-bibliotekspakke
-
- dep: libstdc++6 (>= 5)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid
-
- dep: spaln-data
- Opdelingsparat transkript-sammenligning til genomisk DNA - data
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
Download spaln
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 3.0.2+dfsg-2 | 527.4 kB | 2,362.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 3.0.2+dfsg-2 | 550.0 kB | 1,901.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 3.0.2+dfsg-2 | 492.8 kB | 2,230.0 kB | [list of files] |
| hppa (unofficial port) | 2.4.7+dfsg-1 | 330.7 kB | 799.0 kB | [list of files] |
| ia64 (unofficial port) | 3.0.2+dfsg-2 | 679.9 kB | 3,602.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 2.4.7+dfsg-1 | 306.2 kB | 811.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 3.0.2+dfsg-2 | 529.1 kB | 2,342.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 3.0.2+dfsg-2 | 555.4 kB | 2,690.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 3.0.2+dfsg-2 | 561.4 kB | 2,615.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 3.0.2+dfsg-2 | 652.4 kB | 3,349.0 kB | [list of files] |
| s390x | 3.0.2+dfsg-2 | 567.8 kB | 2,024.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 2.4.7+dfsg-1 | 373.7 kB | 713.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 3.0.2+dfsg-2 | 502.1 kB | 14,483.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 2.4.7+dfsg-1 | 337.2 kB | 813.0 kB | [list of files] |