Balík: spaln (3.0.2+dfsg-2 a iné)

Odkazy pre spaln

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík spaln:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA

Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.

spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom spaln

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.33) [hppa, m68k, sh4, x32]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64]

podporná knižnica GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie hppa, ia64, m68k, riscv64, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

podporná knižnica GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

podporná knižnica GCC
dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [nie hppa, m68k, sh4, x32]

GNU Scientific Library (GSL) - balík knižnice
dep: libgslcblas0 (>= 2.7.1) [sparc64]

GNU Scientific Library (GSL) - balík knižnice blas
dep: libstdc++6 (>= 5)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: libunwind8 [ia64]

nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory
dep: spaln-data

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť spaln

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	3.0.2+dfsg-2	527.4 kB	2,362.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	3.0.2+dfsg-2	550.0 kB	1,901.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	3.0.2+dfsg-2	492.8 kB	2,230.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	2.4.7+dfsg-1	330.7 kB	799.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	3.0.2+dfsg-2	679.9 kB	3,602.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	2.4.7+dfsg-1	306.2 kB	811.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	3.0.2+dfsg-2	529.1 kB	2,342.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	3.0.2+dfsg-2	555.4 kB	2,690.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	3.0.2+dfsg-2	561.4 kB	2,615.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	3.0.2+dfsg-2	652.4 kB	3,349.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	3.0.2+dfsg-2	567.8 kB	2,024.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	2.4.7+dfsg-1	373.7 kB	713.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	3.0.2+dfsg-2	502.1 kB	14,483.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	2.4.7+dfsg-1	337.2 kB	813.0 kB	[zoznam súborov]