Paket: canu (2.0+dfsg-2 ve diğerleri)

canu için bağlantılar

Debian Kaynakları:

canu Kaynak Paketini İndir:

Geliştirici:

Debian Med Packaging Team (QA Sayfası, Posta Arşivi)

Dış Kaynaklar:

Ana Sayfa [canu.readthedocs.org]

Benzer paketler:

single molecule sequence assembler for genomes

Canu is a fork of the Celera Assembler, designed for high-noise single-molecule sequencing (such as the PacBio RS II or Oxford Nanopore MinION).

Canu is a hierarchical assembly pipeline which runs in four steps:

 * Detect overlaps in high-noise sequences using MHAP
 * Generate corrected sequence consensus
 * Trim corrected sequences
 * Assemble trimmed corrected sequences

canu ile İlgili Diğer Paketler

bağımlılıklar

tavsiye edilen

önerilen

enhances

dep: gnuplot

Command-line driven interactive plotting program.
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb
dep: libfilesys-df-perl

Module to obtain filesystem disk space information
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, i386, mipsel değil]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3
dep: mhap

locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

sug: nanopolish

consensus caller for nanopore sequencing data
sug: pbgenomicconsensus

Paket mevcut değil

canu indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
amd64	2.0+dfsg-2+b1	1.182,4 kB	8.799,0 kB	[dosya listesi]
arm64	2.0+dfsg-2+b1	1.077,8 kB	9.886,0 kB	[dosya listesi]
armel	2.0+dfsg-2+b1	1.027,4 kB	9.663,0 kB	[dosya listesi]
armhf	2.0+dfsg-2+b1	1.041,9 kB	7.955,0 kB	[dosya listesi]
i386	2.0+dfsg-2+b1	1.317,8 kB	10.030,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	2.0+dfsg-2+b1	1.297,2 kB	12.589,0 kB	[dosya listesi]
mipsel	2.0+dfsg-2+b1	1.351,8 kB	12.568,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	2.0+dfsg-2+b1	1.204,7 kB	12.855,0 kB	[dosya listesi]
s390x	2.0+dfsg-2+b1	1.073,5 kB	8.954,0 kB	[dosya listesi]