Pakiet: ncbi-blast+ (2.17.0+ds-1 i inne)

Odnośniki dla ncbi-blast+

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego ncbi-blast+:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [www.ncbi.nlm.nih.gov]

Podobne pakiety:

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Przeznaczenie: use::analysing, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z ncbi-blast+

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, m68k, sh4]

Biblioteka wsparcia zapewniająca wbudowane funkcje __atomic
dep: libbz2-1.0

Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, loong64, sh4]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 14.2.0-19) [loong64]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, x32]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgomp1 (>= 6)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

Biblioteka współdzielona LMDB (Lightning Memory-Mapped Database)
dep: libmbedcrypto16 (>= 3.6.0) [nie alpha, ia64]

lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library
dep: libmbedcrypto7t64 (>= 2.28.0) [alpha, ia64]

lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library
dep: libmbedtls14t64 (>= 2.28.0) [alpha, ia64]

lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library
dep: libmbedtls21 (>= 3.6.0) [nie alpha, ia64]

lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library
dep: libmbedx509-7 (>= 3.6.0) [nie alpha, ia64]

lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library
dep: libncbi-vdb3 (>= 3.2.1+dfsg) [amd64, arm64]

libraries for using data in the INSDC Sequence Read Archives
dep: libnghttp2-14 (>= 1.28.0) [nie alpha, ia64]

Biblioteka implementująca protokół HTTP/2 (biblioteka współdzielona)
dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22) [nie alpha, ia64]

Nowa biblioteka wyrażeń regularnych zgodna z Perl - 8-bitowe pliki uruchomieniowe
dep: libsqlite3-0 (>= 3.6.12) [nie alpha, ia64]

Biblioteka współdzielona SQLite 3
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [alpha, ia64, m68k]

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

dep: libstdc++6 (>= 14) [nie alpha, ia64, m68k]
dep: libunwind8 [ia64]

Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
dep: libuv1 (>= 1.33.1) [x32]

asynchronous event notification library - runtime library
dep: libuv1t64 (>= 1.33.1) [nie alpha, ia64, x32]

asynchronous event notification library - runtime library
dep: libzstd1 (>= 1.5.5) [amd64, arm64]

Algorytm do szybkiej bezstratnej kompresji
dep: ncbi-data

Platform-independent data for the NCBI toolkit
dep: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: sse4.2-support [amd64]

CPU feature checking - require SSE4.2
dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

enh: t-coffee

Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie ncbi-blast+

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2.12.0+ds-4+b1	11 414,4 KiB	59 755,0 KiB	[lista plików]
amd64	2.17.0+ds-1	16 587,1 KiB	71 954,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.17.0+ds-1	14 684,1 KiB	73 146,0 KiB	[lista plików]
armel	2.16.0+ds-7	12 852,0 KiB	60 567,0 KiB	[lista plików]
armhf	2.16.0+ds-7	13 117,6 KiB	50 136,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.16.0+ds-7	14 764,6 KiB	70 293,0 KiB	[lista plików]
i386	2.16.0+ds-7	16 216,4 KiB	68 340,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.12.0+ds-4+b1	13 417,0 KiB	85 192,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	2.16.0+ds-7	13 977,1 KiB	68 362,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.16.0+ds-7	14 127,3 KiB	61 838,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.16.0+ds-7	11 851,5 KiB	87 015,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.16.0+ds-7	14 665,2 KiB	86 223,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.16.0+ds-7	14 625,5 KiB	79 183,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.16.0+ds-7	14 369,6 KiB	56 126,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.16.0+ds-7	14 171,8 KiB	66 162,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2.16.0+ds-7	25 847,0 KiB	177 196,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2.16.0+ds-7	12 226,9 KiB	149 925,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2.16.0+ds-6+b1	14 955,6 KiB	60 947,0 KiB	[lista plików]