[ buster ] [ bullseye ] [ bullseye-backports ] [ bookworm ] [ trixie ] [ sid ]

[ Източник: ncbi-blast+ ]

Пакет: ncbi-blast+ (2.12.0+ds-4 и други)

Връзки за ncbi-blast+

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник ncbi-blast+.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [www.ncbi.nlm.nih.gov]

Подобни пакети:

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Purpose: use::analysing, works-with::biological-sequence

Други пакети, свързани с ncbi-blast+

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libbz2-1.0

high-quality block-sorting file compressor library - runtime
dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, x32]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC support library
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC support library
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

Lightning Memory-Mapped Database shared library
dep: libmbedcrypto7t64 (>= 2.28.0)

lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library
dep: libmbedtls14t64 (>= 2.28.0)

lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library
dep: libmbedx509-1t64 (>= 2.28.0) [sparc64]

lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ Library v3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: ncbi-data

Platform-independent data for the NCBI toolkit
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

compression library - runtime

enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

Изтегляне на ncbi-blast+

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	2.12.0+ds-4+b1	11 414,4 кБ	59 755,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	2.12.0+ds-4+b1	12 226,1 кБ	52 824,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2.12.0+ds-4+b1	11 321,3 кБ	56 237,0 кБ	[списък на файловете]
armel	2.12.0+ds-4+b1	10 416,5 кБ	44 383,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	2.12.0+ds-4+b1	10 664,3 кБ	36 159,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	2.12.0+ds-4+b1	12 196,1 кБ	55 431,0 кБ	[списък на файловете]
i386	2.12.0+ds-4+b1	13 067,7 кБ	51 440,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	2.12.0+ds-4+b1	13 417,0 кБ	85 192,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	2.12.0+ds-4+b1	11 678,1 кБ	48 393,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	2.12.0+ds-4+b1	8 912,6 кБ	61 322,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	2.12.0+ds-4+b1	12 120,1 кБ	68 076,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	2.12.0+ds-4+b1	12 133,2 кБ	63 275,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	2.12.0+ds-4+b2	11 810,1 кБ	43 898,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	2.12.0+ds-4+b1	11 697,8 кБ	52 282,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	2.12.0+ds-4+b1	13 662,6 кБ	51 600,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	2.12.0+ds-4+b1	10 724,6 кБ	141 421,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	2.12.0+ds-4+b1	12 208,2 кБ	47 947,0 кБ	[списък на файловете]