Pakiet: ncbi-blast+ (2.16.0+ds-7)

Odnośniki dla ncbi-blast+

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego ncbi-blast+:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [www.ncbi.nlm.nih.gov]

Podobne pakiety:

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Przeznaczenie: use::analysing, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z ncbi-blast+

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libbz2-1.0

Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
dep: libc6 (>= 2.38)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libgomp1 (>= 6)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

Biblioteka współdzielona LMDB (Lightning Memory-Mapped Database)
dep: libmbedcrypto16 (>= 3.6.0)

lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library
dep: libmbedtls21 (>= 3.6.0)

lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library
dep: libmbedx509-7 (>= 3.6.0)

lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library
dep: libncbi-vdb3 (>= 3.2.1+dfsg) [amd64, arm64]

libraries for using data in the INSDC Sequence Read Archives
dep: libnghttp2-14 (>= 1.28.0)

Biblioteka implementująca protokół HTTP/2 (biblioteka współdzielona)
dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

Nowa biblioteka wyrażeń regularnych zgodna z Perl - 8-bitowe pliki uruchomieniowe
dep: libsqlite3-0 (>= 3.6.12)

Biblioteka współdzielona SQLite 3
dep: libstdc++6 (>= 14)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: libuv1t64 (>= 1.33.1)

asynchronous event notification library - runtime library
dep: libzstd1 (>= 1.5.5) [amd64, arm64]

Algorytm do szybkiej bezstratnej kompresji
dep: ncbi-data

Platform-independent data for the NCBI toolkit
dep: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

enh: t-coffee

Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie ncbi-blast+

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	15 609,3 KiB	70 546,0 KiB	[lista plików]
arm64	14 119,1 KiB	73 195,0 KiB	[lista plików]
armhf	13 117,6 KiB	50 136,0 KiB	[lista plików]
i386	16 216,4 KiB	68 340,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	14 625,5 KiB	79 183,0 KiB	[lista plików]
riscv64	14 369,6 KiB	56 126,0 KiB	[lista plików]
s390x	14 171,8 KiB	66 162,0 KiB	[lista plików]