Pakiet: bitseq (0.7.5+dfsg-7)

Odnośniki dla bitseq

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego bitseq:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data

BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.

Inne pakiety związane z bitseq

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, loong64, sh4]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, s390x, x32]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, loong64, mips64el, riscv64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgomp1 (>= 6)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 11) [nie alpha]

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

dep: libstdc++6 (>= 14.2.0-19) [alpha]
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: python3-numpy

Biblioteka Pythona do obliczeń numerycznych (Python 3)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

sug: samtools

Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

Pobieranie bitseq

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	350,2 KiB	2 416,0 KiB	[lista plików]
amd64	351,4 KiB	2 047,0 KiB	[lista plików]
arm64	304,6 KiB	2 215,0 KiB	[lista plików]
armel	289,1 KiB	2 074,0 KiB	[lista plików]
armhf	291,9 KiB	1 498,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	307,8 KiB	1 669,0 KiB	[lista plików]
i386	371,7 KiB	2 066,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	314,3 KiB	2 215,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	314,9 KiB	1 730,0 KiB	[lista plików]
mips64el	337,1 KiB	2 491,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	349,8 KiB	2 919,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	350,3 KiB	2 599,0 KiB	[lista plików]
riscv64	336,4 KiB	1 451,0 KiB	[lista plików]
s390x	332,3 KiB	2 039,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	367,8 KiB	2 075,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	299,5 KiB	13 449,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	354,7 KiB	1 894,0 KiB	[lista plików]